Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmem238A9JSM3 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmem238A9JSM3 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmem238A9JSM3 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmem238A9JSM3 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmem238A9JSM3 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmem238A9JSM3 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmem238A9JSM3 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmem238A9JSM3 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmem238A9JSM3 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmem238A9JSM3 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmem238A9JSM3 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmem238A9JSM3 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmem238A9JSM3 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmem238A9JSM3 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmem238A9JSM3 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmem238A9JSM3 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmem238A9JSM3 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmem238A9JSM3 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmem238A9JSM3 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmem238A9JSM3 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmem238A9JSM3 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmem238A9JSM3 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmem238A9JSM3 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmem238A9JSM3 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmem238A9JSM3 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmem238A9JSM3 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmem238A9JSM3 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmem238A9JSM3 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmem238A9JSM3 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmem238A9JSM3 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmem238A9JSM3 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmem238A9JSM3 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmem238A9JSM3 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmem238A9JSM3 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmem238A9JSM3 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmem238A9JSM3 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmem238A9JSM3 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmem238A9JSM3 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem238A9JSM3 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem238A9JSM3 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem238A9JSM3 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem238A9JSM3 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem238A9JSM3 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem238A9JSM3 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem238A9JSM3 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem238A9JSM3 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem238A9JSM3 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem238A9JSM3 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem238A9JSM3 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem238A9JSM3 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem238A9JSM3 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem238A9JSM3 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem238A9JSM3 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem238A9JSM3 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem238A9JSM3 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem238A9JSM3 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem238A9JSM3 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem238A9JSM3 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem238A9JSM3 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem238A9JSM3 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem238A9JSM3 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem238A9JSM3 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem238A9JSM3 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem238A9JSM3 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem238A9JSM3 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem238A9JSM3 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem238A9JSM3 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem238A9JSM3 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem238A9JSM3 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem238A9JSM3 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem238A9JSM3 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem238A9JSM3 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem238A9JSM3 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem238A9JSM3 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem238A9JSM3 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem238A9JSM3 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem238A9JSM3 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem238A9JSM3 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem238A9JSM3 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem238A9JSM3 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem238A9JSM3 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem238A9JSM3 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmem238A9JSM3 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Tmem238A9JSM3 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms