Protein–RNA interactions for Protein: A4Q9F4

Ttll11, Tubulin polyglutamylase TTLL11, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll11A4Q9F4 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttll11A4Q9F4 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttll11A4Q9F4 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttll11A4Q9F4 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttll11A4Q9F4 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttll11A4Q9F4 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttll11A4Q9F4 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttll11A4Q9F4 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttll11A4Q9F4 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttll11A4Q9F4 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttll11A4Q9F4 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttll11A4Q9F4 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttll11A4Q9F4 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttll11A4Q9F4 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttll11A4Q9F4 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttll11A4Q9F4 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttll11A4Q9F4 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttll11A4Q9F4 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttll11A4Q9F4 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttll11A4Q9F4 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttll11A4Q9F4 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttll11A4Q9F4 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttll11A4Q9F4 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttll11A4Q9F4 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttll11A4Q9F4 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttll11A4Q9F4 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttll11A4Q9F4 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttll11A4Q9F4 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttll11A4Q9F4 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttll11A4Q9F4 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttll11A4Q9F4 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttll11A4Q9F4 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttll11A4Q9F4 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttll11A4Q9F4 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttll11A4Q9F4 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttll11A4Q9F4 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttll11A4Q9F4 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttll11A4Q9F4 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttll11A4Q9F4 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttll11A4Q9F4 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttll11A4Q9F4 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttll11A4Q9F4 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttll11A4Q9F4 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttll11A4Q9F4 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttll11A4Q9F4 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttll11A4Q9F4 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttll11A4Q9F4 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttll11A4Q9F4 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttll11A4Q9F4 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttll11A4Q9F4 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttll11A4Q9F4 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttll11A4Q9F4 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttll11A4Q9F4 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttll11A4Q9F4 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttll11A4Q9F4 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttll11A4Q9F4 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttll11A4Q9F4 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttll11A4Q9F4 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttll11A4Q9F4 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttll11A4Q9F4 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttll11A4Q9F4 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttll11A4Q9F4 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttll11A4Q9F4 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttll11A4Q9F4 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttll11A4Q9F4 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ttll11A4Q9F4 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ttll11A4Q9F4 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ttll11A4Q9F4 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ttll11A4Q9F4 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ttll11A4Q9F4 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ttll11A4Q9F4 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ttll11A4Q9F4 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ttll11A4Q9F4 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ttll11A4Q9F4 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ttll11A4Q9F4 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ttll11A4Q9F4 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ttll11A4Q9F4 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ttll11A4Q9F4 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ttll11A4Q9F4 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ttll11A4Q9F4 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ttll11A4Q9F4 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ttll11A4Q9F4 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ttll11A4Q9F4 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ttll11A4Q9F4 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ttll11A4Q9F4 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ttll11A4Q9F4 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ttll11A4Q9F4 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ttll11A4Q9F4 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ttll11A4Q9F4 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ttll11A4Q9F4 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ttll11A4Q9F4 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ttll11A4Q9F4 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ttll11A4Q9F4 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ttll11A4Q9F4 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ttll11A4Q9F4 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ttll11A4Q9F4 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ttll11A4Q9F4 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ttll11A4Q9F4 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ttll11A4Q9F4 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ttll11A4Q9F4 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms