Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ07

Tubb1, Tubulin beta-1 chain, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb1A2AQ07 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubb1A2AQ07 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubb1A2AQ07 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubb1A2AQ07 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubb1A2AQ07 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubb1A2AQ07 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubb1A2AQ07 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubb1A2AQ07 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubb1A2AQ07 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubb1A2AQ07 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubb1A2AQ07 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubb1A2AQ07 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubb1A2AQ07 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubb1A2AQ07 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubb1A2AQ07 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubb1A2AQ07 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubb1A2AQ07 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubb1A2AQ07 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubb1A2AQ07 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubb1A2AQ07 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubb1A2AQ07 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubb1A2AQ07 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubb1A2AQ07 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubb1A2AQ07 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubb1A2AQ07 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubb1A2AQ07 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubb1A2AQ07 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubb1A2AQ07 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubb1A2AQ07 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubb1A2AQ07 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubb1A2AQ07 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubb1A2AQ07 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubb1A2AQ07 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubb1A2AQ07 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubb1A2AQ07 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubb1A2AQ07 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubb1A2AQ07 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubb1A2AQ07 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubb1A2AQ07 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubb1A2AQ07 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubb1A2AQ07 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubb1A2AQ07 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubb1A2AQ07 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubb1A2AQ07 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubb1A2AQ07 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubb1A2AQ07 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubb1A2AQ07 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubb1A2AQ07 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubb1A2AQ07 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubb1A2AQ07 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubb1A2AQ07 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubb1A2AQ07 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubb1A2AQ07 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubb1A2AQ07 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubb1A2AQ07 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubb1A2AQ07 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubb1A2AQ07 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubb1A2AQ07 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubb1A2AQ07 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubb1A2AQ07 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubb1A2AQ07 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubb1A2AQ07 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubb1A2AQ07 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubb1A2AQ07 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubb1A2AQ07 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubb1A2AQ07 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubb1A2AQ07 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubb1A2AQ07 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubb1A2AQ07 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubb1A2AQ07 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubb1A2AQ07 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubb1A2AQ07 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubb1A2AQ07 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubb1A2AQ07 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubb1A2AQ07 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubb1A2AQ07 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubb1A2AQ07 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubb1A2AQ07 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubb1A2AQ07 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubb1A2AQ07 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubb1A2AQ07 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubb1A2AQ07 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubb1A2AQ07 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubb1A2AQ07 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubb1A2AQ07 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubb1A2AQ07 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubb1A2AQ07 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubb1A2AQ07 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubb1A2AQ07 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubb1A2AQ07 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubb1A2AQ07 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubb1A2AQ07 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubb1A2AQ07 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubb1A2AQ07 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubb1A2AQ07 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubb1A2AQ07 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubb1A2AQ07 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubb1A2AQ07 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubb1A2AQ07 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubb1A2AQ07 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms