Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Syndig1A2ANU3 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Syndig1A2ANU3 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Syndig1A2ANU3 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Syndig1A2ANU3 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Syndig1A2ANU3 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Syndig1A2ANU3 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Syndig1A2ANU3 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Syndig1A2ANU3 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Syndig1A2ANU3 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Syndig1A2ANU3 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Syndig1A2ANU3 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Syndig1A2ANU3 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Syndig1A2ANU3 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Syndig1A2ANU3 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Syndig1A2ANU3 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Syndig1A2ANU3 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Syndig1A2ANU3 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Syndig1A2ANU3 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Syndig1A2ANU3 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Syndig1A2ANU3 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Syndig1A2ANU3 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Syndig1A2ANU3 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Syndig1A2ANU3 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Syndig1A2ANU3 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Syndig1A2ANU3 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Syndig1A2ANU3 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Syndig1A2ANU3 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Syndig1A2ANU3 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Syndig1A2ANU3 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Syndig1A2ANU3 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Syndig1A2ANU3 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Syndig1A2ANU3 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Syndig1A2ANU3 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Syndig1A2ANU3 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Syndig1A2ANU3 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Syndig1A2ANU3 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Syndig1A2ANU3 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Syndig1A2ANU3 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Syndig1A2ANU3 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Syndig1A2ANU3 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Syndig1A2ANU3 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Syndig1A2ANU3 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Syndig1A2ANU3 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Syndig1A2ANU3 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Syndig1A2ANU3 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Syndig1A2ANU3 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Syndig1A2ANU3 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Syndig1A2ANU3 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Syndig1A2ANU3 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Syndig1A2ANU3 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Syndig1A2ANU3 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Syndig1A2ANU3 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Syndig1A2ANU3 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Syndig1A2ANU3 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Syndig1A2ANU3 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Syndig1A2ANU3 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Syndig1A2ANU3 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Syndig1A2ANU3 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Syndig1A2ANU3 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Syndig1A2ANU3 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Syndig1A2ANU3 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Syndig1A2ANU3 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Syndig1A2ANU3 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Syndig1A2ANU3 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Syndig1A2ANU3 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Syndig1A2ANU3 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Syndig1A2ANU3 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Syndig1A2ANU3 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Syndig1A2ANU3 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Syndig1A2ANU3 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Syndig1A2ANU3 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Syndig1A2ANU3 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Syndig1A2ANU3 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Syndig1A2ANU3 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Syndig1A2ANU3 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Syndig1A2ANU3 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Syndig1A2ANU3 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Syndig1A2ANU3 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Syndig1A2ANU3 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Syndig1A2ANU3 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Syndig1A2ANU3 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Syndig1A2ANU3 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Syndig1A2ANU3 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Syndig1A2ANU3 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Syndig1A2ANU3 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Syndig1A2ANU3 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Syndig1A2ANU3 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Syndig1A2ANU3 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Syndig1A2ANU3 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Syndig1A2ANU3 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Syndig1A2ANU3 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Syndig1A2ANU3 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Syndig1A2ANU3 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Syndig1A2ANU3 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Syndig1A2ANU3 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Syndig1A2ANU3 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Syndig1A2ANU3 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Syndig1A2ANU3 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Syndig1A2ANU3 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms