Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR2

4930447F04Rik, RIKEN cDNA 4930447F04 gene, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930447F04RikA2AFR2 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
4930447F04RikA2AFR2 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
4930447F04RikA2AFR2 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
4930447F04RikA2AFR2 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
4930447F04RikA2AFR2 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
4930447F04RikA2AFR2 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
4930447F04RikA2AFR2 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
4930447F04RikA2AFR2 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
4930447F04RikA2AFR2 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
4930447F04RikA2AFR2 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
4930447F04RikA2AFR2 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
4930447F04RikA2AFR2 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
4930447F04RikA2AFR2 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
4930447F04RikA2AFR2 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
4930447F04RikA2AFR2 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
4930447F04RikA2AFR2 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
4930447F04RikA2AFR2 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
4930447F04RikA2AFR2 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
4930447F04RikA2AFR2 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
4930447F04RikA2AFR2 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
4930447F04RikA2AFR2 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
4930447F04RikA2AFR2 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
4930447F04RikA2AFR2 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
4930447F04RikA2AFR2 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
4930447F04RikA2AFR2 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
4930447F04RikA2AFR2 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
4930447F04RikA2AFR2 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
4930447F04RikA2AFR2 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
4930447F04RikA2AFR2 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
4930447F04RikA2AFR2 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
4930447F04RikA2AFR2 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
4930447F04RikA2AFR2 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
4930447F04RikA2AFR2 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
4930447F04RikA2AFR2 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
4930447F04RikA2AFR2 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
4930447F04RikA2AFR2 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
4930447F04RikA2AFR2 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
4930447F04RikA2AFR2 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
4930447F04RikA2AFR2 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
4930447F04RikA2AFR2 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
4930447F04RikA2AFR2 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
4930447F04RikA2AFR2 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
4930447F04RikA2AFR2 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
4930447F04RikA2AFR2 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
4930447F04RikA2AFR2 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
4930447F04RikA2AFR2 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
4930447F04RikA2AFR2 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
4930447F04RikA2AFR2 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
4930447F04RikA2AFR2 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
4930447F04RikA2AFR2 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
4930447F04RikA2AFR2 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
4930447F04RikA2AFR2 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
4930447F04RikA2AFR2 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
4930447F04RikA2AFR2 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
4930447F04RikA2AFR2 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
4930447F04RikA2AFR2 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
4930447F04RikA2AFR2 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
4930447F04RikA2AFR2 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
4930447F04RikA2AFR2 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
4930447F04RikA2AFR2 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
4930447F04RikA2AFR2 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
4930447F04RikA2AFR2 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
4930447F04RikA2AFR2 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
4930447F04RikA2AFR2 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
4930447F04RikA2AFR2 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
4930447F04RikA2AFR2 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
4930447F04RikA2AFR2 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
4930447F04RikA2AFR2 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
4930447F04RikA2AFR2 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
4930447F04RikA2AFR2 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
4930447F04RikA2AFR2 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
4930447F04RikA2AFR2 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
4930447F04RikA2AFR2 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
4930447F04RikA2AFR2 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
4930447F04RikA2AFR2 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
4930447F04RikA2AFR2 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
4930447F04RikA2AFR2 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
4930447F04RikA2AFR2 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
4930447F04RikA2AFR2 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
4930447F04RikA2AFR2 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
4930447F04RikA2AFR2 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
4930447F04RikA2AFR2 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
4930447F04RikA2AFR2 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
4930447F04RikA2AFR2 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
4930447F04RikA2AFR2 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
4930447F04RikA2AFR2 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
4930447F04RikA2AFR2 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
4930447F04RikA2AFR2 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
4930447F04RikA2AFR2 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
4930447F04RikA2AFR2 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
4930447F04RikA2AFR2 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
4930447F04RikA2AFR2 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
4930447F04RikA2AFR2 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
4930447F04RikA2AFR2 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
4930447F04RikA2AFR2 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
4930447F04RikA2AFR2 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
4930447F04RikA2AFR2 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
4930447F04RikA2AFR2 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
4930447F04RikA2AFR2 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
4930447F04RikA2AFR2 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms