Protein–RNA interactions for Protein: A2ACT7

Col9a3, Collagen, type IX, alpha 3, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a3A2ACT7 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Col9a3A2ACT7 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col9a3A2ACT7 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col9a3A2ACT7 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col9a3A2ACT7 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Col9a3A2ACT7 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Col9a3A2ACT7 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col9a3A2ACT7 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col9a3A2ACT7 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col9a3A2ACT7 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col9a3A2ACT7 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col9a3A2ACT7 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col9a3A2ACT7 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col9a3A2ACT7 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col9a3A2ACT7 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col9a3A2ACT7 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col9a3A2ACT7 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col9a3A2ACT7 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col9a3A2ACT7 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col9a3A2ACT7 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col9a3A2ACT7 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col9a3A2ACT7 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col9a3A2ACT7 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col9a3A2ACT7 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col9a3A2ACT7 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col9a3A2ACT7 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col9a3A2ACT7 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col9a3A2ACT7 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Col9a3A2ACT7 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col9a3A2ACT7 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col9a3A2ACT7 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col9a3A2ACT7 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col9a3A2ACT7 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col9a3A2ACT7 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col9a3A2ACT7 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col9a3A2ACT7 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col9a3A2ACT7 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col9a3A2ACT7 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Col9a3A2ACT7 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col9a3A2ACT7 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col9a3A2ACT7 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col9a3A2ACT7 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col9a3A2ACT7 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col9a3A2ACT7 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col9a3A2ACT7 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col9a3A2ACT7 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col9a3A2ACT7 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Col9a3A2ACT7 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col9a3A2ACT7 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col9a3A2ACT7 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Col9a3A2ACT7 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Col9a3A2ACT7 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col9a3A2ACT7 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col9a3A2ACT7 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col9a3A2ACT7 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col9a3A2ACT7 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Col9a3A2ACT7 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col9a3A2ACT7 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col9a3A2ACT7 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col9a3A2ACT7 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col9a3A2ACT7 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col9a3A2ACT7 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col9a3A2ACT7 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col9a3A2ACT7 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col9a3A2ACT7 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col9a3A2ACT7 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col9a3A2ACT7 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col9a3A2ACT7 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col9a3A2ACT7 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col9a3A2ACT7 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col9a3A2ACT7 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col9a3A2ACT7 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col9a3A2ACT7 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col9a3A2ACT7 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col9a3A2ACT7 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col9a3A2ACT7 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col9a3A2ACT7 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col9a3A2ACT7 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col9a3A2ACT7 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col9a3A2ACT7 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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