Protein–RNA interactions for Protein: A2ACP1

Ttc39a, Tetratricopeptide repeat protein 39A, mousemouse

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Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39aA2ACP1 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ttc39aA2ACP1 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ttc39aA2ACP1 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ttc39aA2ACP1 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ttc39aA2ACP1 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ttc39aA2ACP1 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ttc39aA2ACP1 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ttc39aA2ACP1 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ttc39aA2ACP1 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ttc39aA2ACP1 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ttc39aA2ACP1 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ttc39aA2ACP1 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ttc39aA2ACP1 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ttc39aA2ACP1 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ttc39aA2ACP1 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ttc39aA2ACP1 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ttc39aA2ACP1 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ttc39aA2ACP1 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ttc39aA2ACP1 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ttc39aA2ACP1 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ttc39aA2ACP1 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ttc39aA2ACP1 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ttc39aA2ACP1 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ttc39aA2ACP1 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ttc39aA2ACP1 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ttc39aA2ACP1 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ttc39aA2ACP1 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ttc39aA2ACP1 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ttc39aA2ACP1 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ttc39aA2ACP1 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ttc39aA2ACP1 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ttc39aA2ACP1 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ttc39aA2ACP1 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ttc39aA2ACP1 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ttc39aA2ACP1 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ttc39aA2ACP1 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ttc39aA2ACP1 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ttc39aA2ACP1 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ttc39aA2ACP1 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ttc39aA2ACP1 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ttc39aA2ACP1 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ttc39aA2ACP1 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ttc39aA2ACP1 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ttc39aA2ACP1 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ttc39aA2ACP1 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ttc39aA2ACP1 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ttc39aA2ACP1 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ttc39aA2ACP1 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ttc39aA2ACP1 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ttc39aA2ACP1 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ttc39aA2ACP1 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ttc39aA2ACP1 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Ttc39aA2ACP1 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ttc39aA2ACP1 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Ttc39aA2ACP1 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ttc39aA2ACP1 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ttc39aA2ACP1 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ttc39aA2ACP1 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Ttc39aA2ACP1 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ttc39aA2ACP1 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Ttc39aA2ACP1 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Ttc39aA2ACP1 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ttc39aA2ACP1 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Ttc39aA2ACP1 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ttc39aA2ACP1 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ttc39aA2ACP1 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ttc39aA2ACP1 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ttc39aA2ACP1 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ttc39aA2ACP1 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ttc39aA2ACP1 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ttc39aA2ACP1 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ttc39aA2ACP1 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ttc39aA2ACP1 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ttc39aA2ACP1 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ttc39aA2ACP1 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ttc39aA2ACP1 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ttc39aA2ACP1 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ttc39aA2ACP1 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ttc39aA2ACP1 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ttc39aA2ACP1 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc39aA2ACP1 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc39aA2ACP1 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc39aA2ACP1 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc39aA2ACP1 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc39aA2ACP1 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc39aA2ACP1 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc39aA2ACP1 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc39aA2ACP1 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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