Protein–RNA interactions for Protein: A2ABU4

Myom3, Myomesin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myom3A2ABU4 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Myom3A2ABU4 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Myom3A2ABU4 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Myom3A2ABU4 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Myom3A2ABU4 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Myom3A2ABU4 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Myom3A2ABU4 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Myom3A2ABU4 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Myom3A2ABU4 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Myom3A2ABU4 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Myom3A2ABU4 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Myom3A2ABU4 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Myom3A2ABU4 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Myom3A2ABU4 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Myom3A2ABU4 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Myom3A2ABU4 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Myom3A2ABU4 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Myom3A2ABU4 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Myom3A2ABU4 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Myom3A2ABU4 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Myom3A2ABU4 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Myom3A2ABU4 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Myom3A2ABU4 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Myom3A2ABU4 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Myom3A2ABU4 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Myom3A2ABU4 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Myom3A2ABU4 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Myom3A2ABU4 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Myom3A2ABU4 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Myom3A2ABU4 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Myom3A2ABU4 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Myom3A2ABU4 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Myom3A2ABU4 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Myom3A2ABU4 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Myom3A2ABU4 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Myom3A2ABU4 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Myom3A2ABU4 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Myom3A2ABU4 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Myom3A2ABU4 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Myom3A2ABU4 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Myom3A2ABU4 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Myom3A2ABU4 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Myom3A2ABU4 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Myom3A2ABU4 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Myom3A2ABU4 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Myom3A2ABU4 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Myom3A2ABU4 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Myom3A2ABU4 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Myom3A2ABU4 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Myom3A2ABU4 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Myom3A2ABU4 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Myom3A2ABU4 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Myom3A2ABU4 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Myom3A2ABU4 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Myom3A2ABU4 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Myom3A2ABU4 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Myom3A2ABU4 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Myom3A2ABU4 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Myom3A2ABU4 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Myom3A2ABU4 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Myom3A2ABU4 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Myom3A2ABU4 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Myom3A2ABU4 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Myom3A2ABU4 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Myom3A2ABU4 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Myom3A2ABU4 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Myom3A2ABU4 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Myom3A2ABU4 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Myom3A2ABU4 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Myom3A2ABU4 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Myom3A2ABU4 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Myom3A2ABU4 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Myom3A2ABU4 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Myom3A2ABU4 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Myom3A2ABU4 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Myom3A2ABU4 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Myom3A2ABU4 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Myom3A2ABU4 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Myom3A2ABU4 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Myom3A2ABU4 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Myom3A2ABU4 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Myom3A2ABU4 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Myom3A2ABU4 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Myom3A2ABU4 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Myom3A2ABU4 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Myom3A2ABU4 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Myom3A2ABU4 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Myom3A2ABU4 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Myom3A2ABU4 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Myom3A2ABU4 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Myom3A2ABU4 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Myom3A2ABU4 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Myom3A2ABU4 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Myom3A2ABU4 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Myom3A2ABU4 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Myom3A2ABU4 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Myom3A2ABU4 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Myom3A2ABU4 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Myom3A2ABU4 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Myom3A2ABU4 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms