Protein–RNA interactions for Protein: A2A9G7

Shisal2a, Protein shisa-like-2A, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisal2aA2A9G7 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Shisal2aA2A9G7 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Shisal2aA2A9G7 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Shisal2aA2A9G7 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Shisal2aA2A9G7 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Shisal2aA2A9G7 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Shisal2aA2A9G7 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Shisal2aA2A9G7 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Shisal2aA2A9G7 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Shisal2aA2A9G7 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Shisal2aA2A9G7 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Shisal2aA2A9G7 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Shisal2aA2A9G7 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Shisal2aA2A9G7 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Shisal2aA2A9G7 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Shisal2aA2A9G7 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Shisal2aA2A9G7 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Shisal2aA2A9G7 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Shisal2aA2A9G7 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Shisal2aA2A9G7 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Shisal2aA2A9G7 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Shisal2aA2A9G7 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Shisal2aA2A9G7 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Shisal2aA2A9G7 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Shisal2aA2A9G7 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Shisal2aA2A9G7 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Shisal2aA2A9G7 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Shisal2aA2A9G7 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Shisal2aA2A9G7 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Shisal2aA2A9G7 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Shisal2aA2A9G7 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Shisal2aA2A9G7 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Shisal2aA2A9G7 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Shisal2aA2A9G7 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Shisal2aA2A9G7 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Shisal2aA2A9G7 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Shisal2aA2A9G7 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Shisal2aA2A9G7 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Shisal2aA2A9G7 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Shisal2aA2A9G7 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Shisal2aA2A9G7 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Shisal2aA2A9G7 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Shisal2aA2A9G7 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Shisal2aA2A9G7 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Shisal2aA2A9G7 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Shisal2aA2A9G7 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Shisal2aA2A9G7 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Shisal2aA2A9G7 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Shisal2aA2A9G7 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Shisal2aA2A9G7 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Shisal2aA2A9G7 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Shisal2aA2A9G7 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Shisal2aA2A9G7 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Shisal2aA2A9G7 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Shisal2aA2A9G7 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Shisal2aA2A9G7 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Shisal2aA2A9G7 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Shisal2aA2A9G7 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Shisal2aA2A9G7 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Shisal2aA2A9G7 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Shisal2aA2A9G7 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Shisal2aA2A9G7 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Shisal2aA2A9G7 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Shisal2aA2A9G7 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Shisal2aA2A9G7 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Shisal2aA2A9G7 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Shisal2aA2A9G7 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Shisal2aA2A9G7 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Shisal2aA2A9G7 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Shisal2aA2A9G7 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Shisal2aA2A9G7 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Shisal2aA2A9G7 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Shisal2aA2A9G7 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Shisal2aA2A9G7 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Shisal2aA2A9G7 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Shisal2aA2A9G7 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Shisal2aA2A9G7 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Shisal2aA2A9G7 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Shisal2aA2A9G7 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Shisal2aA2A9G7 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Shisal2aA2A9G7 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Shisal2aA2A9G7 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Shisal2aA2A9G7 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Shisal2aA2A9G7 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Shisal2aA2A9G7 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Shisal2aA2A9G7 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Shisal2aA2A9G7 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Shisal2aA2A9G7 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Shisal2aA2A9G7 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Shisal2aA2A9G7 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Shisal2aA2A9G7 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Shisal2aA2A9G7 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Shisal2aA2A9G7 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Shisal2aA2A9G7 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Shisal2aA2A9G7 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Shisal2aA2A9G7 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Shisal2aA2A9G7 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Shisal2aA2A9G7 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Shisal2aA2A9G7 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Shisal2aA2A9G7 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms