Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PtprfA2A8L5 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PtprfA2A8L5 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PtprfA2A8L5 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PtprfA2A8L5 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PtprfA2A8L5 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PtprfA2A8L5 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PtprfA2A8L5 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PtprfA2A8L5 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PtprfA2A8L5 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PtprfA2A8L5 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PtprfA2A8L5 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PtprfA2A8L5 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PtprfA2A8L5 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PtprfA2A8L5 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PtprfA2A8L5 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
PtprfA2A8L5 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PtprfA2A8L5 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PtprfA2A8L5 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PtprfA2A8L5 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PtprfA2A8L5 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PtprfA2A8L5 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PtprfA2A8L5 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PtprfA2A8L5 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PtprfA2A8L5 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PtprfA2A8L5 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PtprfA2A8L5 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PtprfA2A8L5 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PtprfA2A8L5 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PtprfA2A8L5 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PtprfA2A8L5 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PtprfA2A8L5 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PtprfA2A8L5 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PtprfA2A8L5 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PtprfA2A8L5 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PtprfA2A8L5 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PtprfA2A8L5 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PtprfA2A8L5 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PtprfA2A8L5 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PtprfA2A8L5 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PtprfA2A8L5 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PtprfA2A8L5 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PtprfA2A8L5 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PtprfA2A8L5 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PtprfA2A8L5 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PtprfA2A8L5 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PtprfA2A8L5 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PtprfA2A8L5 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PtprfA2A8L5 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PtprfA2A8L5 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PtprfA2A8L5 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PtprfA2A8L5 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PtprfA2A8L5 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PtprfA2A8L5 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PtprfA2A8L5 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
PtprfA2A8L5 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PtprfA2A8L5 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PtprfA2A8L5 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PtprfA2A8L5 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PtprfA2A8L5 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PtprfA2A8L5 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PtprfA2A8L5 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PtprfA2A8L5 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PtprfA2A8L5 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PtprfA2A8L5 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PtprfA2A8L5 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PtprfA2A8L5 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
PtprfA2A8L5 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PtprfA2A8L5 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PtprfA2A8L5 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PtprfA2A8L5 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PtprfA2A8L5 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PtprfA2A8L5 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PtprfA2A8L5 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PtprfA2A8L5 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PtprfA2A8L5 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PtprfA2A8L5 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PtprfA2A8L5 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PtprfA2A8L5 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PtprfA2A8L5 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PtprfA2A8L5 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PtprfA2A8L5 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PtprfA2A8L5 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PtprfA2A8L5 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PtprfA2A8L5 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PtprfA2A8L5 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PtprfA2A8L5 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PtprfA2A8L5 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PtprfA2A8L5 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PtprfA2A8L5 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PtprfA2A8L5 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PtprfA2A8L5 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PtprfA2A8L5 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PtprfA2A8L5 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PtprfA2A8L5 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PtprfA2A8L5 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PtprfA2A8L5 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PtprfA2A8L5 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PtprfA2A8L5 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
PtprfA2A8L5 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms