Protein–RNA interactions for Protein: A2A5X4

Krtap29-1, Keratin-associated protein 29-1, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap29-1A2A5X4 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Krtap29-1A2A5X4 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Krtap29-1A2A5X4 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Krtap29-1A2A5X4 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Krtap29-1A2A5X4 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Krtap29-1A2A5X4 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Krtap29-1A2A5X4 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Krtap29-1A2A5X4 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Krtap29-1A2A5X4 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Krtap29-1A2A5X4 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Krtap29-1A2A5X4 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Krtap29-1A2A5X4 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Krtap29-1A2A5X4 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Krtap29-1A2A5X4 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Krtap29-1A2A5X4 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Krtap29-1A2A5X4 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Krtap29-1A2A5X4 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Krtap29-1A2A5X4 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Krtap29-1A2A5X4 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Krtap29-1A2A5X4 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Krtap29-1A2A5X4 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Krtap29-1A2A5X4 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Krtap29-1A2A5X4 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Krtap29-1A2A5X4 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Krtap29-1A2A5X4 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Krtap29-1A2A5X4 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Krtap29-1A2A5X4 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.92
Krtap29-1A2A5X4 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.92
Krtap29-1A2A5X4 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.92
Krtap29-1A2A5X4 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.92
Krtap29-1A2A5X4 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Krtap29-1A2A5X4 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Krtap29-1A2A5X4 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Krtap29-1A2A5X4 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Krtap29-1A2A5X4 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Krtap29-1A2A5X4 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Krtap29-1A2A5X4 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Krtap29-1A2A5X4 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Krtap29-1A2A5X4 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Krtap29-1A2A5X4 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Krtap29-1A2A5X4 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Krtap29-1A2A5X4 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Krtap29-1A2A5X4 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Krtap29-1A2A5X4 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Krtap29-1A2A5X4 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Krtap29-1A2A5X4 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Krtap29-1A2A5X4 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Krtap29-1A2A5X4 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Krtap29-1A2A5X4 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Krtap29-1A2A5X4 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Krtap29-1A2A5X4 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Krtap29-1A2A5X4 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Krtap29-1A2A5X4 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Krtap29-1A2A5X4 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Krtap29-1A2A5X4 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Krtap29-1A2A5X4 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Krtap29-1A2A5X4 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Krtap29-1A2A5X4 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Krtap29-1A2A5X4 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Krtap29-1A2A5X4 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Krtap29-1A2A5X4 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Krtap29-1A2A5X4 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Krtap29-1A2A5X4 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Krtap29-1A2A5X4 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Krtap29-1A2A5X4 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Krtap29-1A2A5X4 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Krtap29-1A2A5X4 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Krtap29-1A2A5X4 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Krtap29-1A2A5X4 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Krtap29-1A2A5X4 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Krtap29-1A2A5X4 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Krtap29-1A2A5X4 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Krtap29-1A2A5X4 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Krtap29-1A2A5X4 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Krtap29-1A2A5X4 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Krtap29-1A2A5X4 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Krtap29-1A2A5X4 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Krtap29-1A2A5X4 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Krtap29-1A2A5X4 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Krtap29-1A2A5X4 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Krtap29-1A2A5X4 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Krtap29-1A2A5X4 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Krtap29-1A2A5X4 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Krtap29-1A2A5X4 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Krtap29-1A2A5X4 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Krtap29-1A2A5X4 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Krtap29-1A2A5X4 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Krtap29-1A2A5X4 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Krtap29-1A2A5X4 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Krtap29-1A2A5X4 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Krtap29-1A2A5X4 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Krtap29-1A2A5X4 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Krtap29-1A2A5X4 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Krtap29-1A2A5X4 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Krtap29-1A2A5X4 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Krtap29-1A2A5X4 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Krtap29-1A2A5X4 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Krtap29-1A2A5X4 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Krtap29-1A2A5X4 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Krtap29-1A2A5X4 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms