Protein–RNA interactions for Protein: A1Z198

Nlrp1b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1b allele 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1bA1Z198 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nlrp1bA1Z198 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nlrp1bA1Z198 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nlrp1bA1Z198 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nlrp1bA1Z198 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nlrp1bA1Z198 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nlrp1bA1Z198 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nlrp1bA1Z198 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nlrp1bA1Z198 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Nlrp1bA1Z198 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nlrp1bA1Z198 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nlrp1bA1Z198 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nlrp1bA1Z198 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nlrp1bA1Z198 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nlrp1bA1Z198 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Nlrp1bA1Z198 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nlrp1bA1Z198 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nlrp1bA1Z198 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nlrp1bA1Z198 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nlrp1bA1Z198 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nlrp1bA1Z198 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nlrp1bA1Z198 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nlrp1bA1Z198 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nlrp1bA1Z198 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nlrp1bA1Z198 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nlrp1bA1Z198 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nlrp1bA1Z198 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nlrp1bA1Z198 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nlrp1bA1Z198 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nlrp1bA1Z198 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nlrp1bA1Z198 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nlrp1bA1Z198 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nlrp1bA1Z198 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nlrp1bA1Z198 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nlrp1bA1Z198 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nlrp1bA1Z198 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nlrp1bA1Z198 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Nlrp1bA1Z198 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nlrp1bA1Z198 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nlrp1bA1Z198 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nlrp1bA1Z198 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nlrp1bA1Z198 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nlrp1bA1Z198 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Nlrp1bA1Z198 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nlrp1bA1Z198 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nlrp1bA1Z198 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nlrp1bA1Z198 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nlrp1bA1Z198 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nlrp1bA1Z198 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nlrp1bA1Z198 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nlrp1bA1Z198 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nlrp1bA1Z198 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nlrp1bA1Z198 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nlrp1bA1Z198 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nlrp1bA1Z198 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nlrp1bA1Z198 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nlrp1bA1Z198 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nlrp1bA1Z198 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nlrp1bA1Z198 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nlrp1bA1Z198 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nlrp1bA1Z198 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nlrp1bA1Z198 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nlrp1bA1Z198 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nlrp1bA1Z198 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nlrp1bA1Z198 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Nlrp1bA1Z198 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nlrp1bA1Z198 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nlrp1bA1Z198 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nlrp1bA1Z198 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nlrp1bA1Z198 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nlrp1bA1Z198 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nlrp1bA1Z198 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nlrp1bA1Z198 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nlrp1bA1Z198 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nlrp1bA1Z198 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nlrp1bA1Z198 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nlrp1bA1Z198 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nlrp1bA1Z198 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nlrp1bA1Z198 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nlrp1bA1Z198 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrp1bA1Z198 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrp1bA1Z198 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrp1bA1Z198 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrp1bA1Z198 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrp1bA1Z198 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrp1bA1Z198 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrp1bA1Z198 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrp1bA1Z198 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrp1bA1Z198 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrp1bA1Z198 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrp1bA1Z198 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrp1bA1Z198 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrp1bA1Z198 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrp1bA1Z198 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrp1bA1Z198 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrp1bA1Z198 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrp1bA1Z198 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrp1bA1Z198 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrp1bA1Z198 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrp1bA1Z198 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms