Protein–RNA interactions for Protein: A0N8N6

Trav12-2, T cell receptor alpha variable 12-2 (Fragment), mousemouse

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav12-2A0N8N6 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trav12-2A0N8N6 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trav12-2A0N8N6 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trav12-2A0N8N6 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trav12-2A0N8N6 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Trav12-2A0N8N6 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trav12-2A0N8N6 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Trav12-2A0N8N6 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trav12-2A0N8N6 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trav12-2A0N8N6 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trav12-2A0N8N6 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trav12-2A0N8N6 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trav12-2A0N8N6 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trav12-2A0N8N6 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trav12-2A0N8N6 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trav12-2A0N8N6 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trav12-2A0N8N6 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trav12-2A0N8N6 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trav12-2A0N8N6 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trav12-2A0N8N6 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trav12-2A0N8N6 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trav12-2A0N8N6 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trav12-2A0N8N6 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trav12-2A0N8N6 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trav12-2A0N8N6 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Trav12-2A0N8N6 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trav12-2A0N8N6 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trav12-2A0N8N6 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trav12-2A0N8N6 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trav12-2A0N8N6 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trav12-2A0N8N6 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trav12-2A0N8N6 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trav12-2A0N8N6 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trav12-2A0N8N6 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trav12-2A0N8N6 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trav12-2A0N8N6 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trav12-2A0N8N6 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trav12-2A0N8N6 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trav12-2A0N8N6 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Trav12-2A0N8N6 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trav12-2A0N8N6 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trav12-2A0N8N6 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Trav12-2A0N8N6 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trav12-2A0N8N6 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trav12-2A0N8N6 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trav12-2A0N8N6 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trav12-2A0N8N6 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trav12-2A0N8N6 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Trav12-2A0N8N6 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trav12-2A0N8N6 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Trav12-2A0N8N6 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trav12-2A0N8N6 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trav12-2A0N8N6 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trav12-2A0N8N6 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trav12-2A0N8N6 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trav12-2A0N8N6 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trav12-2A0N8N6 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trav12-2A0N8N6 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trav12-2A0N8N6 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trav12-2A0N8N6 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trav12-2A0N8N6 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trav12-2A0N8N6 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trav12-2A0N8N6 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Trav12-2A0N8N6 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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Trav12-2A0N8N6 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trav12-2A0N8N6 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trav12-2A0N8N6 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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Trav12-2A0N8N6 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trav12-2A0N8N6 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trav12-2A0N8N6 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trav12-2A0N8N6 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trav12-2A0N8N6 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trav12-2A0N8N6 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trav12-2A0N8N6 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trav12-2A0N8N6 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trav12-2A0N8N6 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trav12-2A0N8N6 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trav12-2A0N8N6 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trav12-2A0N8N6 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trav12-2A0N8N6 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trav12-2A0N8N6 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trav12-2A0N8N6 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trav12-2A0N8N6 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trav12-2A0N8N6 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trav12-2A0N8N6 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trav12-2A0N8N6 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trav12-2A0N8N6 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trav12-2A0N8N6 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trav12-2A0N8N6 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trav12-2A0N8N6 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trav12-2A0N8N6 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trav12-2A0N8N6 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trav12-2A0N8N6 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trav12-2A0N8N6 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trav12-2A0N8N6 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trav12-2A0N8N6 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trav12-2A0N8N6 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trav12-2A0N8N6 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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