Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP1

Speer3, MCG129800, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer3W4VSP1 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Speer3W4VSP1 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Speer3W4VSP1 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Speer3W4VSP1 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Speer3W4VSP1 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Speer3W4VSP1 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Speer3W4VSP1 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Speer3W4VSP1 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Speer3W4VSP1 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Speer3W4VSP1 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Speer3W4VSP1 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Speer3W4VSP1 Ccl25-201ENSMUST00000024004 1058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Speer3W4VSP1 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Speer3W4VSP1 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Speer3W4VSP1 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Speer3W4VSP1 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Speer3W4VSP1 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Speer3W4VSP1 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Speer3W4VSP1 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Speer3W4VSP1 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Speer3W4VSP1 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Speer3W4VSP1 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Speer3W4VSP1 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Speer3W4VSP1 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Speer3W4VSP1 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Speer3W4VSP1 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Speer3W4VSP1 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Speer3W4VSP1 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Speer3W4VSP1 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Speer3W4VSP1 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Speer3W4VSP1 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Speer3W4VSP1 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Speer3W4VSP1 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Speer3W4VSP1 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Speer3W4VSP1 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Speer3W4VSP1 Gm20618-202ENSMUST00000177482 1227 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Speer3W4VSP1 Gm31409-201ENSMUST00000209894 710 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Speer3W4VSP1 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Speer3W4VSP1 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Speer3W4VSP1 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Speer3W4VSP1 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Speer3W4VSP1 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Speer3W4VSP1 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Speer3W4VSP1 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Speer3W4VSP1 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Speer3W4VSP1 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Speer3W4VSP1 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Speer3W4VSP1 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Speer3W4VSP1 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Speer3W4VSP1 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Speer3W4VSP1 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Speer3W4VSP1 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Speer3W4VSP1 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Speer3W4VSP1 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Speer3W4VSP1 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Speer3W4VSP1 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Speer3W4VSP1 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Speer3W4VSP1 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Speer3W4VSP1 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Speer3W4VSP1 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Speer3W4VSP1 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Speer3W4VSP1 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Speer3W4VSP1 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Speer3W4VSP1 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Speer3W4VSP1 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Speer3W4VSP1 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Speer3W4VSP1 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Speer3W4VSP1 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Speer3W4VSP1 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Speer3W4VSP1 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Speer3W4VSP1 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Speer3W4VSP1 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Speer3W4VSP1 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Speer3W4VSP1 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Speer3W4VSP1 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Speer3W4VSP1 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Speer3W4VSP1 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Speer3W4VSP1 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Speer3W4VSP1 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Speer3W4VSP1 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Speer3W4VSP1 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Speer3W4VSP1 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Speer3W4VSP1 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Speer3W4VSP1 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Speer3W4VSP1 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Speer3W4VSP1 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Speer3W4VSP1 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Speer3W4VSP1 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Speer3W4VSP1 Gemin6-201ENSMUST00000069486 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Speer3W4VSP1 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Speer3W4VSP1 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Speer3W4VSP1 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Speer3W4VSP1 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Speer3W4VSP1 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Speer3W4VSP1 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Speer3W4VSP1 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Speer3W4VSP1 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Speer3W4VSP1 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Speer3W4VSP1 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Speer3W4VSP1 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.8 ms