Protein–RNA interactions for Protein: V9GXR0

H2-Bl, Histocompatibility 2, blastocyst, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-BlV9GXR0 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-BlV9GXR0 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-BlV9GXR0 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-BlV9GXR0 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-BlV9GXR0 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-BlV9GXR0 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-BlV9GXR0 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-BlV9GXR0 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-BlV9GXR0 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-BlV9GXR0 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-BlV9GXR0 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-BlV9GXR0 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-BlV9GXR0 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-BlV9GXR0 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-BlV9GXR0 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-BlV9GXR0 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-BlV9GXR0 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-BlV9GXR0 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-BlV9GXR0 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-BlV9GXR0 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-BlV9GXR0 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-BlV9GXR0 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-BlV9GXR0 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-BlV9GXR0 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-BlV9GXR0 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-BlV9GXR0 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-BlV9GXR0 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-BlV9GXR0 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-BlV9GXR0 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-BlV9GXR0 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-BlV9GXR0 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-BlV9GXR0 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-BlV9GXR0 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-BlV9GXR0 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-BlV9GXR0 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-BlV9GXR0 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-BlV9GXR0 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-BlV9GXR0 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-BlV9GXR0 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-BlV9GXR0 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-BlV9GXR0 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-BlV9GXR0 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-BlV9GXR0 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-BlV9GXR0 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-BlV9GXR0 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-BlV9GXR0 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-BlV9GXR0 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-BlV9GXR0 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-BlV9GXR0 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-BlV9GXR0 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-BlV9GXR0 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-BlV9GXR0 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-BlV9GXR0 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-BlV9GXR0 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-BlV9GXR0 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-BlV9GXR0 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-BlV9GXR0 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-BlV9GXR0 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-BlV9GXR0 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-BlV9GXR0 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-BlV9GXR0 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-BlV9GXR0 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-BlV9GXR0 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-BlV9GXR0 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-BlV9GXR0 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-BlV9GXR0 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-BlV9GXR0 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-BlV9GXR0 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-BlV9GXR0 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-BlV9GXR0 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-BlV9GXR0 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-BlV9GXR0 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-BlV9GXR0 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-BlV9GXR0 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-BlV9GXR0 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-BlV9GXR0 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-BlV9GXR0 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-BlV9GXR0 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-BlV9GXR0 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-BlV9GXR0 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-BlV9GXR0 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-BlV9GXR0 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-BlV9GXR0 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-BlV9GXR0 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-BlV9GXR0 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-BlV9GXR0 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-BlV9GXR0 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
H2-BlV9GXR0 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-BlV9GXR0 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-BlV9GXR0 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-BlV9GXR0 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-BlV9GXR0 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-BlV9GXR0 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-BlV9GXR0 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-BlV9GXR0 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-BlV9GXR0 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-BlV9GXR0 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-BlV9GXR0 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-BlV9GXR0 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-BlV9GXR0 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms