Protein–RNA interactions for Protein: T1NXB5

Vstm4, V-set and transmembrane domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm4T1NXB5 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vstm4T1NXB5 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Vstm4T1NXB5 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vstm4T1NXB5 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vstm4T1NXB5 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vstm4T1NXB5 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vstm4T1NXB5 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vstm4T1NXB5 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vstm4T1NXB5 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Vstm4T1NXB5 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vstm4T1NXB5 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vstm4T1NXB5 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vstm4T1NXB5 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vstm4T1NXB5 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vstm4T1NXB5 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vstm4T1NXB5 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vstm4T1NXB5 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vstm4T1NXB5 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vstm4T1NXB5 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vstm4T1NXB5 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vstm4T1NXB5 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vstm4T1NXB5 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vstm4T1NXB5 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vstm4T1NXB5 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vstm4T1NXB5 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vstm4T1NXB5 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vstm4T1NXB5 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vstm4T1NXB5 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vstm4T1NXB5 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vstm4T1NXB5 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Vstm4T1NXB5 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vstm4T1NXB5 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vstm4T1NXB5 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Vstm4T1NXB5 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vstm4T1NXB5 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vstm4T1NXB5 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vstm4T1NXB5 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vstm4T1NXB5 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vstm4T1NXB5 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vstm4T1NXB5 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vstm4T1NXB5 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vstm4T1NXB5 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vstm4T1NXB5 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vstm4T1NXB5 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vstm4T1NXB5 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vstm4T1NXB5 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vstm4T1NXB5 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vstm4T1NXB5 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vstm4T1NXB5 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vstm4T1NXB5 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vstm4T1NXB5 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vstm4T1NXB5 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vstm4T1NXB5 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vstm4T1NXB5 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vstm4T1NXB5 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vstm4T1NXB5 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vstm4T1NXB5 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vstm4T1NXB5 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vstm4T1NXB5 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vstm4T1NXB5 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vstm4T1NXB5 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vstm4T1NXB5 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vstm4T1NXB5 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vstm4T1NXB5 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vstm4T1NXB5 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vstm4T1NXB5 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vstm4T1NXB5 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Vstm4T1NXB5 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vstm4T1NXB5 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vstm4T1NXB5 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vstm4T1NXB5 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vstm4T1NXB5 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Vstm4T1NXB5 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vstm4T1NXB5 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vstm4T1NXB5 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Vstm4T1NXB5 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vstm4T1NXB5 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vstm4T1NXB5 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vstm4T1NXB5 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vstm4T1NXB5 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vstm4T1NXB5 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vstm4T1NXB5 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vstm4T1NXB5 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vstm4T1NXB5 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vstm4T1NXB5 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vstm4T1NXB5 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vstm4T1NXB5 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vstm4T1NXB5 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vstm4T1NXB5 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vstm4T1NXB5 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vstm4T1NXB5 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vstm4T1NXB5 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vstm4T1NXB5 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vstm4T1NXB5 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vstm4T1NXB5 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vstm4T1NXB5 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vstm4T1NXB5 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vstm4T1NXB5 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vstm4T1NXB5 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vstm4T1NXB5 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms