Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hdac5Q9Z2V6 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hdac5Q9Z2V6 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hdac5Q9Z2V6 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hdac5Q9Z2V6 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hdac5Q9Z2V6 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hdac5Q9Z2V6 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hdac5Q9Z2V6 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hdac5Q9Z2V6 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hdac5Q9Z2V6 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hdac5Q9Z2V6 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Hdac5Q9Z2V6 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Hdac5Q9Z2V6 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hdac5Q9Z2V6 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hdac5Q9Z2V6 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hdac5Q9Z2V6 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hdac5Q9Z2V6 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hdac5Q9Z2V6 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hdac5Q9Z2V6 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hdac5Q9Z2V6 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Hdac5Q9Z2V6 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hdac5Q9Z2V6 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hdac5Q9Z2V6 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hdac5Q9Z2V6 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hdac5Q9Z2V6 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hdac5Q9Z2V6 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hdac5Q9Z2V6 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hdac5Q9Z2V6 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hdac5Q9Z2V6 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hdac5Q9Z2V6 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hdac5Q9Z2V6 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hdac5Q9Z2V6 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Hdac5Q9Z2V6 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hdac5Q9Z2V6 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hdac5Q9Z2V6 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hdac5Q9Z2V6 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hdac5Q9Z2V6 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hdac5Q9Z2V6 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hdac5Q9Z2V6 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hdac5Q9Z2V6 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hdac5Q9Z2V6 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hdac5Q9Z2V6 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hdac5Q9Z2V6 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hdac5Q9Z2V6 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hdac5Q9Z2V6 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hdac5Q9Z2V6 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hdac5Q9Z2V6 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hdac5Q9Z2V6 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hdac5Q9Z2V6 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Hdac5Q9Z2V6 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hdac5Q9Z2V6 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Hdac5Q9Z2V6 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hdac5Q9Z2V6 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hdac5Q9Z2V6 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hdac5Q9Z2V6 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hdac5Q9Z2V6 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hdac5Q9Z2V6 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hdac5Q9Z2V6 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hdac5Q9Z2V6 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hdac5Q9Z2V6 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hdac5Q9Z2V6 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hdac5Q9Z2V6 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hdac5Q9Z2V6 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hdac5Q9Z2V6 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hdac5Q9Z2V6 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hdac5Q9Z2V6 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hdac5Q9Z2V6 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hdac5Q9Z2V6 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hdac5Q9Z2V6 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hdac5Q9Z2V6 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hdac5Q9Z2V6 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hdac5Q9Z2V6 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hdac5Q9Z2V6 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hdac5Q9Z2V6 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hdac5Q9Z2V6 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hdac5Q9Z2V6 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hdac5Q9Z2V6 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hdac5Q9Z2V6 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hdac5Q9Z2V6 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Hdac5Q9Z2V6 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hdac5Q9Z2V6 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hdac5Q9Z2V6 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hdac5Q9Z2V6 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hdac5Q9Z2V6 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hdac5Q9Z2V6 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hdac5Q9Z2V6 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hdac5Q9Z2V6 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hdac5Q9Z2V6 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hdac5Q9Z2V6 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hdac5Q9Z2V6 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hdac5Q9Z2V6 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hdac5Q9Z2V6 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hdac5Q9Z2V6 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hdac5Q9Z2V6 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hdac5Q9Z2V6 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hdac5Q9Z2V6 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hdac5Q9Z2V6 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hdac5Q9Z2V6 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hdac5Q9Z2V6 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hdac5Q9Z2V6 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms