Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2K1

Krt16, Keratin, type I cytoskeletal 16, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt16Q9Z2K1 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt16Q9Z2K1 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt16Q9Z2K1 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt16Q9Z2K1 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt16Q9Z2K1 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt16Q9Z2K1 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt16Q9Z2K1 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt16Q9Z2K1 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt16Q9Z2K1 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt16Q9Z2K1 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt16Q9Z2K1 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt16Q9Z2K1 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt16Q9Z2K1 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt16Q9Z2K1 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt16Q9Z2K1 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt16Q9Z2K1 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt16Q9Z2K1 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt16Q9Z2K1 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt16Q9Z2K1 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt16Q9Z2K1 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt16Q9Z2K1 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt16Q9Z2K1 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt16Q9Z2K1 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt16Q9Z2K1 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt16Q9Z2K1 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt16Q9Z2K1 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt16Q9Z2K1 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt16Q9Z2K1 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt16Q9Z2K1 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt16Q9Z2K1 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt16Q9Z2K1 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt16Q9Z2K1 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt16Q9Z2K1 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt16Q9Z2K1 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt16Q9Z2K1 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt16Q9Z2K1 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt16Q9Z2K1 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt16Q9Z2K1 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt16Q9Z2K1 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt16Q9Z2K1 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt16Q9Z2K1 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt16Q9Z2K1 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt16Q9Z2K1 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt16Q9Z2K1 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt16Q9Z2K1 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt16Q9Z2K1 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt16Q9Z2K1 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt16Q9Z2K1 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt16Q9Z2K1 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt16Q9Z2K1 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt16Q9Z2K1 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt16Q9Z2K1 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt16Q9Z2K1 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt16Q9Z2K1 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt16Q9Z2K1 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt16Q9Z2K1 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt16Q9Z2K1 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt16Q9Z2K1 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt16Q9Z2K1 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt16Q9Z2K1 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Krt16Q9Z2K1 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Krt16Q9Z2K1 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Krt16Q9Z2K1 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Krt16Q9Z2K1 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Krt16Q9Z2K1 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Krt16Q9Z2K1 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Krt16Q9Z2K1 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Krt16Q9Z2K1 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Krt16Q9Z2K1 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Krt16Q9Z2K1 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Krt16Q9Z2K1 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Krt16Q9Z2K1 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Krt16Q9Z2K1 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt16Q9Z2K1 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt16Q9Z2K1 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt16Q9Z2K1 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt16Q9Z2K1 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt16Q9Z2K1 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt16Q9Z2K1 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt16Q9Z2K1 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt16Q9Z2K1 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt16Q9Z2K1 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt16Q9Z2K1 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt16Q9Z2K1 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt16Q9Z2K1 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt16Q9Z2K1 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt16Q9Z2K1 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt16Q9Z2K1 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt16Q9Z2K1 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt16Q9Z2K1 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt16Q9Z2K1 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt16Q9Z2K1 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt16Q9Z2K1 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt16Q9Z2K1 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt16Q9Z2K1 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt16Q9Z2K1 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt16Q9Z2K1 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt16Q9Z2K1 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt16Q9Z2K1 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt16Q9Z2K1 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms