Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2J0

Slc23a1, Solute carrier family 23 member 1, mousemouse

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc23a1Q9Z2J0 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc23a1Q9Z2J0 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc23a1Q9Z2J0 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc23a1Q9Z2J0 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc23a1Q9Z2J0 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc23a1Q9Z2J0 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc23a1Q9Z2J0 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc23a1Q9Z2J0 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc23a1Q9Z2J0 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc23a1Q9Z2J0 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc23a1Q9Z2J0 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc23a1Q9Z2J0 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc23a1Q9Z2J0 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc23a1Q9Z2J0 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc23a1Q9Z2J0 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc23a1Q9Z2J0 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc23a1Q9Z2J0 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc23a1Q9Z2J0 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc23a1Q9Z2J0 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc23a1Q9Z2J0 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc23a1Q9Z2J0 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc23a1Q9Z2J0 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc23a1Q9Z2J0 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc23a1Q9Z2J0 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc23a1Q9Z2J0 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc23a1Q9Z2J0 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc23a1Q9Z2J0 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc23a1Q9Z2J0 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc23a1Q9Z2J0 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc23a1Q9Z2J0 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc23a1Q9Z2J0 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc23a1Q9Z2J0 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc23a1Q9Z2J0 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc23a1Q9Z2J0 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc23a1Q9Z2J0 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc23a1Q9Z2J0 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc23a1Q9Z2J0 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc23a1Q9Z2J0 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc23a1Q9Z2J0 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc23a1Q9Z2J0 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc23a1Q9Z2J0 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc23a1Q9Z2J0 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc23a1Q9Z2J0 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc23a1Q9Z2J0 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc23a1Q9Z2J0 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc23a1Q9Z2J0 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc23a1Q9Z2J0 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc23a1Q9Z2J0 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc23a1Q9Z2J0 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc23a1Q9Z2J0 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc23a1Q9Z2J0 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc23a1Q9Z2J0 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc23a1Q9Z2J0 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc23a1Q9Z2J0 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc23a1Q9Z2J0 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc23a1Q9Z2J0 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc23a1Q9Z2J0 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc23a1Q9Z2J0 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc23a1Q9Z2J0 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc23a1Q9Z2J0 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc23a1Q9Z2J0 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc23a1Q9Z2J0 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc23a1Q9Z2J0 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc23a1Q9Z2J0 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc23a1Q9Z2J0 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc23a1Q9Z2J0 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc23a1Q9Z2J0 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc23a1Q9Z2J0 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc23a1Q9Z2J0 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc23a1Q9Z2J0 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc23a1Q9Z2J0 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc23a1Q9Z2J0 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc23a1Q9Z2J0 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc23a1Q9Z2J0 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc23a1Q9Z2J0 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc23a1Q9Z2J0 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc23a1Q9Z2J0 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc23a1Q9Z2J0 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc23a1Q9Z2J0 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc23a1Q9Z2J0 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc23a1Q9Z2J0 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc23a1Q9Z2J0 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc23a1Q9Z2J0 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc23a1Q9Z2J0 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc23a1Q9Z2J0 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc23a1Q9Z2J0 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc23a1Q9Z2J0 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc23a1Q9Z2J0 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc23a1Q9Z2J0 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc23a1Q9Z2J0 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc23a1Q9Z2J0 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc23a1Q9Z2J0 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc23a1Q9Z2J0 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc23a1Q9Z2J0 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc23a1Q9Z2J0 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc23a1Q9Z2J0 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc23a1Q9Z2J0 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc23a1Q9Z2J0 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc23a1Q9Z2J0 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc23a1Q9Z2J0 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms