Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mbd3Q9Z2D8 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Mbd3Q9Z2D8 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mbd3Q9Z2D8 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mbd3Q9Z2D8 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Mbd3Q9Z2D8 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Mbd3Q9Z2D8 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mbd3Q9Z2D8 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mbd3Q9Z2D8 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mbd3Q9Z2D8 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mbd3Q9Z2D8 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mbd3Q9Z2D8 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mbd3Q9Z2D8 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mbd3Q9Z2D8 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mbd3Q9Z2D8 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mbd3Q9Z2D8 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mbd3Q9Z2D8 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mbd3Q9Z2D8 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Mbd3Q9Z2D8 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mbd3Q9Z2D8 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mbd3Q9Z2D8 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mbd3Q9Z2D8 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mbd3Q9Z2D8 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mbd3Q9Z2D8 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mbd3Q9Z2D8 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mbd3Q9Z2D8 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mbd3Q9Z2D8 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mbd3Q9Z2D8 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mbd3Q9Z2D8 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mbd3Q9Z2D8 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Mbd3Q9Z2D8 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mbd3Q9Z2D8 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mbd3Q9Z2D8 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Mbd3Q9Z2D8 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Mbd3Q9Z2D8 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mbd3Q9Z2D8 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Mbd3Q9Z2D8 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Mbd3Q9Z2D8 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mbd3Q9Z2D8 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Mbd3Q9Z2D8 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mbd3Q9Z2D8 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mbd3Q9Z2D8 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mbd3Q9Z2D8 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mbd3Q9Z2D8 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mbd3Q9Z2D8 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mbd3Q9Z2D8 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mbd3Q9Z2D8 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mbd3Q9Z2D8 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mbd3Q9Z2D8 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mbd3Q9Z2D8 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mbd3Q9Z2D8 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mbd3Q9Z2D8 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mbd3Q9Z2D8 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mbd3Q9Z2D8 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mbd3Q9Z2D8 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mbd3Q9Z2D8 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mbd3Q9Z2D8 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mbd3Q9Z2D8 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mbd3Q9Z2D8 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mbd3Q9Z2D8 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mbd3Q9Z2D8 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mbd3Q9Z2D8 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mbd3Q9Z2D8 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mbd3Q9Z2D8 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Mbd3Q9Z2D8 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mbd3Q9Z2D8 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mbd3Q9Z2D8 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mbd3Q9Z2D8 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mbd3Q9Z2D8 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mbd3Q9Z2D8 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mbd3Q9Z2D8 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mbd3Q9Z2D8 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mbd3Q9Z2D8 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mbd3Q9Z2D8 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Mbd3Q9Z2D8 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Mbd3Q9Z2D8 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Mbd3Q9Z2D8 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Mbd3Q9Z2D8 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Mbd3Q9Z2D8 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Mbd3Q9Z2D8 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Mbd3Q9Z2D8 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Mbd3Q9Z2D8 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Mbd3Q9Z2D8 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Mbd3Q9Z2D8 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Mbd3Q9Z2D8 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Mbd3Q9Z2D8 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Mbd3Q9Z2D8 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Mbd3Q9Z2D8 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Mbd3Q9Z2D8 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Mbd3Q9Z2D8 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Mbd3Q9Z2D8 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Mbd3Q9Z2D8 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Mbd3Q9Z2D8 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Mbd3Q9Z2D8 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mbd3Q9Z2D8 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mbd3Q9Z2D8 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mbd3Q9Z2D8 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mbd3Q9Z2D8 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mbd3Q9Z2D8 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mbd3Q9Z2D8 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms