Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1W9

Stk39, STE20/SPS1-related proline-alanine-rich protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stk39Q9Z1W9 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Stk39Q9Z1W9 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Stk39Q9Z1W9 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Stk39Q9Z1W9 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Stk39Q9Z1W9 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Stk39Q9Z1W9 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Stk39Q9Z1W9 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Stk39Q9Z1W9 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Stk39Q9Z1W9 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Stk39Q9Z1W9 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Stk39Q9Z1W9 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Stk39Q9Z1W9 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Stk39Q9Z1W9 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Stk39Q9Z1W9 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Stk39Q9Z1W9 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Stk39Q9Z1W9 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Stk39Q9Z1W9 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Stk39Q9Z1W9 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Stk39Q9Z1W9 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Stk39Q9Z1W9 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Stk39Q9Z1W9 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Stk39Q9Z1W9 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Stk39Q9Z1W9 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Stk39Q9Z1W9 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Stk39Q9Z1W9 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Stk39Q9Z1W9 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Stk39Q9Z1W9 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Stk39Q9Z1W9 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Stk39Q9Z1W9 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Stk39Q9Z1W9 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Stk39Q9Z1W9 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Stk39Q9Z1W9 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Stk39Q9Z1W9 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Stk39Q9Z1W9 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Stk39Q9Z1W9 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Stk39Q9Z1W9 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Stk39Q9Z1W9 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Stk39Q9Z1W9 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Stk39Q9Z1W9 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Stk39Q9Z1W9 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Stk39Q9Z1W9 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Stk39Q9Z1W9 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Stk39Q9Z1W9 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Stk39Q9Z1W9 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Stk39Q9Z1W9 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Stk39Q9Z1W9 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Stk39Q9Z1W9 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Stk39Q9Z1W9 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Stk39Q9Z1W9 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Stk39Q9Z1W9 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Stk39Q9Z1W9 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Stk39Q9Z1W9 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Stk39Q9Z1W9 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Stk39Q9Z1W9 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Stk39Q9Z1W9 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Stk39Q9Z1W9 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Stk39Q9Z1W9 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Stk39Q9Z1W9 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Stk39Q9Z1W9 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Stk39Q9Z1W9 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Stk39Q9Z1W9 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Stk39Q9Z1W9 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Stk39Q9Z1W9 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Stk39Q9Z1W9 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Stk39Q9Z1W9 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Stk39Q9Z1W9 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Stk39Q9Z1W9 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Stk39Q9Z1W9 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Stk39Q9Z1W9 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Stk39Q9Z1W9 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Stk39Q9Z1W9 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Stk39Q9Z1W9 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Stk39Q9Z1W9 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Stk39Q9Z1W9 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Stk39Q9Z1W9 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Stk39Q9Z1W9 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Stk39Q9Z1W9 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Stk39Q9Z1W9 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Stk39Q9Z1W9 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Stk39Q9Z1W9 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Stk39Q9Z1W9 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Stk39Q9Z1W9 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Stk39Q9Z1W9 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Stk39Q9Z1W9 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Stk39Q9Z1W9 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Stk39Q9Z1W9 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Stk39Q9Z1W9 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Stk39Q9Z1W9 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Stk39Q9Z1W9 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Stk39Q9Z1W9 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Stk39Q9Z1W9 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Stk39Q9Z1W9 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Stk39Q9Z1W9 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Stk39Q9Z1W9 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Stk39Q9Z1W9 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Stk39Q9Z1W9 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Stk39Q9Z1W9 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Stk39Q9Z1W9 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Stk39Q9Z1W9 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Stk39Q9Z1W9 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms