Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Q9

Vars, Valine--tRNA ligase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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VarsQ9Z1Q9 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
VarsQ9Z1Q9 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
VarsQ9Z1Q9 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
VarsQ9Z1Q9 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
VarsQ9Z1Q9 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
VarsQ9Z1Q9 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
VarsQ9Z1Q9 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
VarsQ9Z1Q9 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
VarsQ9Z1Q9 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
VarsQ9Z1Q9 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
VarsQ9Z1Q9 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
VarsQ9Z1Q9 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
VarsQ9Z1Q9 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
VarsQ9Z1Q9 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
VarsQ9Z1Q9 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
VarsQ9Z1Q9 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
VarsQ9Z1Q9 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
VarsQ9Z1Q9 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
VarsQ9Z1Q9 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
VarsQ9Z1Q9 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
VarsQ9Z1Q9 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
VarsQ9Z1Q9 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
VarsQ9Z1Q9 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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VarsQ9Z1Q9 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
VarsQ9Z1Q9 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
VarsQ9Z1Q9 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
VarsQ9Z1Q9 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
VarsQ9Z1Q9 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
VarsQ9Z1Q9 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
VarsQ9Z1Q9 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
VarsQ9Z1Q9 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
VarsQ9Z1Q9 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
VarsQ9Z1Q9 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
VarsQ9Z1Q9 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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VarsQ9Z1Q9 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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VarsQ9Z1Q9 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
VarsQ9Z1Q9 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
VarsQ9Z1Q9 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
VarsQ9Z1Q9 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
VarsQ9Z1Q9 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
VarsQ9Z1Q9 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
VarsQ9Z1Q9 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
VarsQ9Z1Q9 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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VarsQ9Z1Q9 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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VarsQ9Z1Q9 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
VarsQ9Z1Q9 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
VarsQ9Z1Q9 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
VarsQ9Z1Q9 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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VarsQ9Z1Q9 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
VarsQ9Z1Q9 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
VarsQ9Z1Q9 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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VarsQ9Z1Q9 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
VarsQ9Z1Q9 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
VarsQ9Z1Q9 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
VarsQ9Z1Q9 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
VarsQ9Z1Q9 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
VarsQ9Z1Q9 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
VarsQ9Z1Q9 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VarsQ9Z1Q9 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VarsQ9Z1Q9 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VarsQ9Z1Q9 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VarsQ9Z1Q9 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VarsQ9Z1Q9 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VarsQ9Z1Q9 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VarsQ9Z1Q9 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VarsQ9Z1Q9 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VarsQ9Z1Q9 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VarsQ9Z1Q9 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VarsQ9Z1Q9 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VarsQ9Z1Q9 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
VarsQ9Z1Q9 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
VarsQ9Z1Q9 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VarsQ9Z1Q9 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
VarsQ9Z1Q9 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VarsQ9Z1Q9 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms