Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z179

Shcbp1, SHC SH2 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1Q9Z179 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shcbp1Q9Z179 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shcbp1Q9Z179 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shcbp1Q9Z179 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shcbp1Q9Z179 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shcbp1Q9Z179 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shcbp1Q9Z179 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shcbp1Q9Z179 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shcbp1Q9Z179 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shcbp1Q9Z179 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shcbp1Q9Z179 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shcbp1Q9Z179 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Shcbp1Q9Z179 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shcbp1Q9Z179 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shcbp1Q9Z179 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shcbp1Q9Z179 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shcbp1Q9Z179 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shcbp1Q9Z179 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shcbp1Q9Z179 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shcbp1Q9Z179 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shcbp1Q9Z179 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shcbp1Q9Z179 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shcbp1Q9Z179 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shcbp1Q9Z179 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shcbp1Q9Z179 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shcbp1Q9Z179 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shcbp1Q9Z179 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shcbp1Q9Z179 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shcbp1Q9Z179 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Shcbp1Q9Z179 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Shcbp1Q9Z179 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shcbp1Q9Z179 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shcbp1Q9Z179 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shcbp1Q9Z179 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shcbp1Q9Z179 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shcbp1Q9Z179 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shcbp1Q9Z179 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shcbp1Q9Z179 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shcbp1Q9Z179 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shcbp1Q9Z179 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shcbp1Q9Z179 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Shcbp1Q9Z179 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Shcbp1Q9Z179 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Shcbp1Q9Z179 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Shcbp1Q9Z179 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Shcbp1Q9Z179 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Shcbp1Q9Z179 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Shcbp1Q9Z179 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Shcbp1Q9Z179 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Shcbp1Q9Z179 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Shcbp1Q9Z179 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Shcbp1Q9Z179 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Shcbp1Q9Z179 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Shcbp1Q9Z179 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Shcbp1Q9Z179 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Shcbp1Q9Z179 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Shcbp1Q9Z179 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Shcbp1Q9Z179 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Shcbp1Q9Z179 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Shcbp1Q9Z179 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Shcbp1Q9Z179 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Shcbp1Q9Z179 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Shcbp1Q9Z179 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Shcbp1Q9Z179 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Shcbp1Q9Z179 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Shcbp1Q9Z179 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Shcbp1Q9Z179 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Shcbp1Q9Z179 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Shcbp1Q9Z179 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Shcbp1Q9Z179 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Shcbp1Q9Z179 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Shcbp1Q9Z179 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Shcbp1Q9Z179 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Shcbp1Q9Z179 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Shcbp1Q9Z179 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Shcbp1Q9Z179 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Shcbp1Q9Z179 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Shcbp1Q9Z179 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Shcbp1Q9Z179 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Shcbp1Q9Z179 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Shcbp1Q9Z179 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Shcbp1Q9Z179 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Shcbp1Q9Z179 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Shcbp1Q9Z179 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Shcbp1Q9Z179 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Shcbp1Q9Z179 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Shcbp1Q9Z179 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Shcbp1Q9Z179 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Shcbp1Q9Z179 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Shcbp1Q9Z179 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Shcbp1Q9Z179 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Shcbp1Q9Z179 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Shcbp1Q9Z179 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Shcbp1Q9Z179 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Shcbp1Q9Z179 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Shcbp1Q9Z179 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Shcbp1Q9Z179 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Shcbp1Q9Z179 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Shcbp1Q9Z179 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Shcbp1Q9Z179 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms