Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z123

Sema4f, Semaphorin-4F, mousemouse

Predictions only

Length 777 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema4fQ9Z123 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sema4fQ9Z123 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sema4fQ9Z123 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sema4fQ9Z123 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sema4fQ9Z123 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sema4fQ9Z123 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sema4fQ9Z123 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sema4fQ9Z123 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sema4fQ9Z123 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sema4fQ9Z123 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sema4fQ9Z123 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sema4fQ9Z123 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sema4fQ9Z123 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sema4fQ9Z123 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sema4fQ9Z123 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sema4fQ9Z123 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sema4fQ9Z123 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sema4fQ9Z123 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sema4fQ9Z123 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sema4fQ9Z123 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sema4fQ9Z123 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sema4fQ9Z123 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sema4fQ9Z123 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sema4fQ9Z123 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sema4fQ9Z123 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sema4fQ9Z123 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sema4fQ9Z123 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sema4fQ9Z123 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sema4fQ9Z123 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sema4fQ9Z123 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sema4fQ9Z123 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Sema4fQ9Z123 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Sema4fQ9Z123 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Sema4fQ9Z123 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sema4fQ9Z123 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sema4fQ9Z123 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sema4fQ9Z123 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sema4fQ9Z123 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sema4fQ9Z123 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sema4fQ9Z123 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sema4fQ9Z123 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sema4fQ9Z123 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sema4fQ9Z123 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sema4fQ9Z123 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema4fQ9Z123 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema4fQ9Z123 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema4fQ9Z123 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema4fQ9Z123 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema4fQ9Z123 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema4fQ9Z123 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema4fQ9Z123 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema4fQ9Z123 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema4fQ9Z123 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema4fQ9Z123 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema4fQ9Z123 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema4fQ9Z123 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema4fQ9Z123 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema4fQ9Z123 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema4fQ9Z123 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema4fQ9Z123 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema4fQ9Z123 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema4fQ9Z123 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema4fQ9Z123 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema4fQ9Z123 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema4fQ9Z123 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema4fQ9Z123 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema4fQ9Z123 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema4fQ9Z123 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema4fQ9Z123 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema4fQ9Z123 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sema4fQ9Z123 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sema4fQ9Z123 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sema4fQ9Z123 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sema4fQ9Z123 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sema4fQ9Z123 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sema4fQ9Z123 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sema4fQ9Z123 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sema4fQ9Z123 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sema4fQ9Z123 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sema4fQ9Z123 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sema4fQ9Z123 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sema4fQ9Z123 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sema4fQ9Z123 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sema4fQ9Z123 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sema4fQ9Z123 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sema4fQ9Z123 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sema4fQ9Z123 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Sema4fQ9Z123 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sema4fQ9Z123 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sema4fQ9Z123 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sema4fQ9Z123 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sema4fQ9Z123 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sema4fQ9Z123 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sema4fQ9Z123 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sema4fQ9Z123 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sema4fQ9Z123 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sema4fQ9Z123 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sema4fQ9Z123 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sema4fQ9Z123 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sema4fQ9Z123 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75 ms