Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z104

Hmg20b, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20bQ9Z104 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hmg20bQ9Z104 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hmg20bQ9Z104 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hmg20bQ9Z104 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hmg20bQ9Z104 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hmg20bQ9Z104 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hmg20bQ9Z104 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hmg20bQ9Z104 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hmg20bQ9Z104 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hmg20bQ9Z104 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hmg20bQ9Z104 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hmg20bQ9Z104 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hmg20bQ9Z104 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hmg20bQ9Z104 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hmg20bQ9Z104 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hmg20bQ9Z104 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hmg20bQ9Z104 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hmg20bQ9Z104 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hmg20bQ9Z104 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hmg20bQ9Z104 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hmg20bQ9Z104 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hmg20bQ9Z104 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hmg20bQ9Z104 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hmg20bQ9Z104 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hmg20bQ9Z104 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hmg20bQ9Z104 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hmg20bQ9Z104 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hmg20bQ9Z104 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hmg20bQ9Z104 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hmg20bQ9Z104 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hmg20bQ9Z104 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hmg20bQ9Z104 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hmg20bQ9Z104 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hmg20bQ9Z104 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hmg20bQ9Z104 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hmg20bQ9Z104 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Hmg20bQ9Z104 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Hmg20bQ9Z104 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hmg20bQ9Z104 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hmg20bQ9Z104 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hmg20bQ9Z104 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Hmg20bQ9Z104 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hmg20bQ9Z104 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hmg20bQ9Z104 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hmg20bQ9Z104 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hmg20bQ9Z104 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hmg20bQ9Z104 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Hmg20bQ9Z104 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Hmg20bQ9Z104 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hmg20bQ9Z104 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hmg20bQ9Z104 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hmg20bQ9Z104 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hmg20bQ9Z104 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hmg20bQ9Z104 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hmg20bQ9Z104 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hmg20bQ9Z104 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hmg20bQ9Z104 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hmg20bQ9Z104 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Hmg20bQ9Z104 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hmg20bQ9Z104 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hmg20bQ9Z104 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hmg20bQ9Z104 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Hmg20bQ9Z104 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hmg20bQ9Z104 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hmg20bQ9Z104 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hmg20bQ9Z104 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hmg20bQ9Z104 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hmg20bQ9Z104 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hmg20bQ9Z104 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hmg20bQ9Z104 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hmg20bQ9Z104 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hmg20bQ9Z104 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hmg20bQ9Z104 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hmg20bQ9Z104 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hmg20bQ9Z104 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hmg20bQ9Z104 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hmg20bQ9Z104 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hmg20bQ9Z104 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hmg20bQ9Z104 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hmg20bQ9Z104 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Hmg20bQ9Z104 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hmg20bQ9Z104 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hmg20bQ9Z104 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hmg20bQ9Z104 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hmg20bQ9Z104 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hmg20bQ9Z104 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hmg20bQ9Z104 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hmg20bQ9Z104 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hmg20bQ9Z104 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hmg20bQ9Z104 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hmg20bQ9Z104 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hmg20bQ9Z104 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hmg20bQ9Z104 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hmg20bQ9Z104 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hmg20bQ9Z104 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hmg20bQ9Z104 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hmg20bQ9Z104 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hmg20bQ9Z104 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hmg20bQ9Z104 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Hmg20bQ9Z104 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms