Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S7

Cldn9, Claudin-9, mousemouse

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn9Q9Z0S7 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn9Q9Z0S7 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn9Q9Z0S7 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn9Q9Z0S7 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn9Q9Z0S7 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn9Q9Z0S7 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn9Q9Z0S7 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn9Q9Z0S7 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn9Q9Z0S7 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn9Q9Z0S7 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn9Q9Z0S7 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn9Q9Z0S7 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn9Q9Z0S7 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn9Q9Z0S7 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn9Q9Z0S7 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn9Q9Z0S7 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn9Q9Z0S7 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn9Q9Z0S7 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn9Q9Z0S7 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn9Q9Z0S7 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn9Q9Z0S7 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn9Q9Z0S7 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn9Q9Z0S7 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn9Q9Z0S7 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn9Q9Z0S7 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn9Q9Z0S7 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn9Q9Z0S7 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn9Q9Z0S7 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn9Q9Z0S7 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn9Q9Z0S7 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn9Q9Z0S7 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn9Q9Z0S7 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn9Q9Z0S7 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn9Q9Z0S7 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn9Q9Z0S7 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn9Q9Z0S7 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn9Q9Z0S7 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn9Q9Z0S7 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn9Q9Z0S7 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn9Q9Z0S7 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn9Q9Z0S7 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn9Q9Z0S7 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn9Q9Z0S7 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn9Q9Z0S7 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn9Q9Z0S7 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn9Q9Z0S7 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn9Q9Z0S7 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn9Q9Z0S7 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn9Q9Z0S7 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn9Q9Z0S7 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn9Q9Z0S7 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn9Q9Z0S7 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Cldn9Q9Z0S7 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn9Q9Z0S7 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Cldn9Q9Z0S7 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn9Q9Z0S7 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn9Q9Z0S7 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn9Q9Z0S7 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn9Q9Z0S7 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn9Q9Z0S7 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn9Q9Z0S7 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn9Q9Z0S7 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn9Q9Z0S7 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn9Q9Z0S7 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Cldn9Q9Z0S7 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn9Q9Z0S7 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn9Q9Z0S7 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn9Q9Z0S7 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn9Q9Z0S7 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn9Q9Z0S7 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cldn9Q9Z0S7 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cldn9Q9Z0S7 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cldn9Q9Z0S7 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cldn9Q9Z0S7 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cldn9Q9Z0S7 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cldn9Q9Z0S7 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cldn9Q9Z0S7 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cldn9Q9Z0S7 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cldn9Q9Z0S7 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cldn9Q9Z0S7 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cldn9Q9Z0S7 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cldn9Q9Z0S7 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cldn9Q9Z0S7 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cldn9Q9Z0S7 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cldn9Q9Z0S7 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cldn9Q9Z0S7 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cldn9Q9Z0S7 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cldn9Q9Z0S7 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cldn9Q9Z0S7 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cldn9Q9Z0S7 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cldn9Q9Z0S7 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Cldn9Q9Z0S7 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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