Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1Z8

Sorbs3, Vinexin, mousemouse

Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sorbs3Q9R1Z8 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sorbs3Q9R1Z8 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sorbs3Q9R1Z8 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sorbs3Q9R1Z8 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sorbs3Q9R1Z8 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sorbs3Q9R1Z8 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sorbs3Q9R1Z8 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sorbs3Q9R1Z8 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sorbs3Q9R1Z8 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Sorbs3Q9R1Z8 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Sorbs3Q9R1Z8 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sorbs3Q9R1Z8 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sorbs3Q9R1Z8 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Sorbs3Q9R1Z8 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sorbs3Q9R1Z8 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sorbs3Q9R1Z8 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sorbs3Q9R1Z8 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sorbs3Q9R1Z8 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sorbs3Q9R1Z8 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sorbs3Q9R1Z8 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sorbs3Q9R1Z8 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sorbs3Q9R1Z8 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sorbs3Q9R1Z8 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sorbs3Q9R1Z8 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sorbs3Q9R1Z8 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sorbs3Q9R1Z8 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sorbs3Q9R1Z8 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Sorbs3Q9R1Z8 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sorbs3Q9R1Z8 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sorbs3Q9R1Z8 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sorbs3Q9R1Z8 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sorbs3Q9R1Z8 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sorbs3Q9R1Z8 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sorbs3Q9R1Z8 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sorbs3Q9R1Z8 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Sorbs3Q9R1Z8 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sorbs3Q9R1Z8 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sorbs3Q9R1Z8 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sorbs3Q9R1Z8 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sorbs3Q9R1Z8 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sorbs3Q9R1Z8 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sorbs3Q9R1Z8 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Sorbs3Q9R1Z8 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sorbs3Q9R1Z8 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Sorbs3Q9R1Z8 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sorbs3Q9R1Z8 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Sorbs3Q9R1Z8 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sorbs3Q9R1Z8 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Sorbs3Q9R1Z8 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sorbs3Q9R1Z8 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sorbs3Q9R1Z8 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sorbs3Q9R1Z8 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sorbs3Q9R1Z8 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sorbs3Q9R1Z8 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sorbs3Q9R1Z8 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sorbs3Q9R1Z8 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sorbs3Q9R1Z8 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sorbs3Q9R1Z8 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sorbs3Q9R1Z8 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sorbs3Q9R1Z8 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sorbs3Q9R1Z8 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sorbs3Q9R1Z8 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sorbs3Q9R1Z8 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Sorbs3Q9R1Z8 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Sorbs3Q9R1Z8 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sorbs3Q9R1Z8 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sorbs3Q9R1Z8 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Sorbs3Q9R1Z8 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Sorbs3Q9R1Z8 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sorbs3Q9R1Z8 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sorbs3Q9R1Z8 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sorbs3Q9R1Z8 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sorbs3Q9R1Z8 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sorbs3Q9R1Z8 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sorbs3Q9R1Z8 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sorbs3Q9R1Z8 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sorbs3Q9R1Z8 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sorbs3Q9R1Z8 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sorbs3Q9R1Z8 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sorbs3Q9R1Z8 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sorbs3Q9R1Z8 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sorbs3Q9R1Z8 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sorbs3Q9R1Z8 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sorbs3Q9R1Z8 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sorbs3Q9R1Z8 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sorbs3Q9R1Z8 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sorbs3Q9R1Z8 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sorbs3Q9R1Z8 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Sorbs3Q9R1Z8 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sorbs3Q9R1Z8 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sorbs3Q9R1Z8 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sorbs3Q9R1Z8 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Sorbs3Q9R1Z8 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sorbs3Q9R1Z8 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sorbs3Q9R1Z8 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sorbs3Q9R1Z8 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sorbs3Q9R1Z8 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sorbs3Q9R1Z8 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sorbs3Q9R1Z8 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sorbs3Q9R1Z8 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms