Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1W3

Rnf103, E3 ubiquitin-protein ligase RNF103, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf103Q9R1W3 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf103Q9R1W3 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf103Q9R1W3 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf103Q9R1W3 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf103Q9R1W3 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf103Q9R1W3 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf103Q9R1W3 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf103Q9R1W3 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf103Q9R1W3 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf103Q9R1W3 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf103Q9R1W3 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf103Q9R1W3 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf103Q9R1W3 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf103Q9R1W3 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf103Q9R1W3 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf103Q9R1W3 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf103Q9R1W3 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf103Q9R1W3 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf103Q9R1W3 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf103Q9R1W3 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf103Q9R1W3 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf103Q9R1W3 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf103Q9R1W3 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf103Q9R1W3 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf103Q9R1W3 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf103Q9R1W3 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf103Q9R1W3 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf103Q9R1W3 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf103Q9R1W3 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf103Q9R1W3 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf103Q9R1W3 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf103Q9R1W3 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf103Q9R1W3 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf103Q9R1W3 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf103Q9R1W3 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf103Q9R1W3 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf103Q9R1W3 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf103Q9R1W3 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf103Q9R1W3 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf103Q9R1W3 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf103Q9R1W3 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf103Q9R1W3 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf103Q9R1W3 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf103Q9R1W3 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf103Q9R1W3 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf103Q9R1W3 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf103Q9R1W3 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf103Q9R1W3 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf103Q9R1W3 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf103Q9R1W3 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf103Q9R1W3 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf103Q9R1W3 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf103Q9R1W3 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf103Q9R1W3 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf103Q9R1W3 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf103Q9R1W3 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf103Q9R1W3 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf103Q9R1W3 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf103Q9R1W3 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rnf103Q9R1W3 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rnf103Q9R1W3 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rnf103Q9R1W3 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rnf103Q9R1W3 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rnf103Q9R1W3 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rnf103Q9R1W3 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf103Q9R1W3 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf103Q9R1W3 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf103Q9R1W3 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf103Q9R1W3 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf103Q9R1W3 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf103Q9R1W3 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf103Q9R1W3 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf103Q9R1W3 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf103Q9R1W3 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf103Q9R1W3 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf103Q9R1W3 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf103Q9R1W3 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf103Q9R1W3 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf103Q9R1W3 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf103Q9R1W3 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf103Q9R1W3 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf103Q9R1W3 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf103Q9R1W3 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf103Q9R1W3 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf103Q9R1W3 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf103Q9R1W3 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf103Q9R1W3 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf103Q9R1W3 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf103Q9R1W3 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf103Q9R1W3 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf103Q9R1W3 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf103Q9R1W3 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf103Q9R1W3 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf103Q9R1W3 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf103Q9R1W3 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf103Q9R1W3 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf103Q9R1W3 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf103Q9R1W3 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf103Q9R1W3 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf103Q9R1W3 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms