Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P4

Psma1, Proteasome subunit alpha type-1, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma1Q9R1P4 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Psma1Q9R1P4 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Psma1Q9R1P4 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Psma1Q9R1P4 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Psma1Q9R1P4 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Psma1Q9R1P4 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Psma1Q9R1P4 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Psma1Q9R1P4 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Psma1Q9R1P4 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Psma1Q9R1P4 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Psma1Q9R1P4 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Psma1Q9R1P4 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Psma1Q9R1P4 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Psma1Q9R1P4 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Psma1Q9R1P4 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Psma1Q9R1P4 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Psma1Q9R1P4 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Psma1Q9R1P4 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Psma1Q9R1P4 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Psma1Q9R1P4 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Psma1Q9R1P4 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Psma1Q9R1P4 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Psma1Q9R1P4 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Psma1Q9R1P4 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Psma1Q9R1P4 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Psma1Q9R1P4 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Psma1Q9R1P4 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Psma1Q9R1P4 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Psma1Q9R1P4 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Psma1Q9R1P4 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Psma1Q9R1P4 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Psma1Q9R1P4 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Psma1Q9R1P4 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Psma1Q9R1P4 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Psma1Q9R1P4 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Psma1Q9R1P4 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Psma1Q9R1P4 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Psma1Q9R1P4 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Psma1Q9R1P4 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Psma1Q9R1P4 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Psma1Q9R1P4 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Psma1Q9R1P4 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Psma1Q9R1P4 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Psma1Q9R1P4 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Psma1Q9R1P4 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Psma1Q9R1P4 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Psma1Q9R1P4 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Psma1Q9R1P4 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Psma1Q9R1P4 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Psma1Q9R1P4 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Psma1Q9R1P4 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Psma1Q9R1P4 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Psma1Q9R1P4 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Psma1Q9R1P4 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Psma1Q9R1P4 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Psma1Q9R1P4 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Psma1Q9R1P4 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Psma1Q9R1P4 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Psma1Q9R1P4 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Psma1Q9R1P4 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Psma1Q9R1P4 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Psma1Q9R1P4 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Psma1Q9R1P4 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Psma1Q9R1P4 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Psma1Q9R1P4 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Psma1Q9R1P4 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Psma1Q9R1P4 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Psma1Q9R1P4 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Psma1Q9R1P4 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Psma1Q9R1P4 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Psma1Q9R1P4 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Psma1Q9R1P4 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Psma1Q9R1P4 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Psma1Q9R1P4 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Psma1Q9R1P4 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Psma1Q9R1P4 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Psma1Q9R1P4 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Psma1Q9R1P4 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Psma1Q9R1P4 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Psma1Q9R1P4 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Psma1Q9R1P4 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Psma1Q9R1P4 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Psma1Q9R1P4 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Psma1Q9R1P4 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Psma1Q9R1P4 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Psma1Q9R1P4 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Psma1Q9R1P4 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Psma1Q9R1P4 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Psma1Q9R1P4 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Psma1Q9R1P4 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Psma1Q9R1P4 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Psma1Q9R1P4 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Psma1Q9R1P4 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Psma1Q9R1P4 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Psma1Q9R1P4 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Psma1Q9R1P4 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Psma1Q9R1P4 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Psma1Q9R1P4 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Psma1Q9R1P4 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Psma1Q9R1P4 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms