Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0Q8

Clec4e, C-type lectin domain family 4 member E, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec4eQ9R0Q8 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Clec4eQ9R0Q8 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Clec4eQ9R0Q8 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Clec4eQ9R0Q8 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Clec4eQ9R0Q8 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Clec4eQ9R0Q8 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Clec4eQ9R0Q8 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Clec4eQ9R0Q8 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Clec4eQ9R0Q8 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Clec4eQ9R0Q8 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Clec4eQ9R0Q8 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Clec4eQ9R0Q8 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Clec4eQ9R0Q8 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Clec4eQ9R0Q8 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Clec4eQ9R0Q8 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Clec4eQ9R0Q8 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Clec4eQ9R0Q8 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Clec4eQ9R0Q8 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Clec4eQ9R0Q8 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Clec4eQ9R0Q8 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Clec4eQ9R0Q8 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Clec4eQ9R0Q8 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Clec4eQ9R0Q8 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Clec4eQ9R0Q8 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
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Clec4eQ9R0Q8 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Clec4eQ9R0Q8 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Clec4eQ9R0Q8 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Clec4eQ9R0Q8 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Clec4eQ9R0Q8 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Clec4eQ9R0Q8 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Clec4eQ9R0Q8 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Clec4eQ9R0Q8 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Clec4eQ9R0Q8 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Clec4eQ9R0Q8 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Clec4eQ9R0Q8 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Clec4eQ9R0Q8 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Clec4eQ9R0Q8 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Clec4eQ9R0Q8 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Clec4eQ9R0Q8 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Clec4eQ9R0Q8 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Clec4eQ9R0Q8 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Clec4eQ9R0Q8 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Clec4eQ9R0Q8 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Clec4eQ9R0Q8 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Clec4eQ9R0Q8 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Clec4eQ9R0Q8 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Clec4eQ9R0Q8 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Clec4eQ9R0Q8 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Clec4eQ9R0Q8 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Clec4eQ9R0Q8 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Clec4eQ9R0Q8 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Clec4eQ9R0Q8 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Clec4eQ9R0Q8 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Clec4eQ9R0Q8 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Clec4eQ9R0Q8 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Clec4eQ9R0Q8 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Clec4eQ9R0Q8 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Clec4eQ9R0Q8 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Clec4eQ9R0Q8 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Clec4eQ9R0Q8 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Clec4eQ9R0Q8 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Clec4eQ9R0Q8 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Clec4eQ9R0Q8 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Clec4eQ9R0Q8 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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