Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0Q3

Tmed2, Transmembrane emp24 domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed2Q9R0Q3 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmed2Q9R0Q3 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmed2Q9R0Q3 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmed2Q9R0Q3 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmed2Q9R0Q3 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmed2Q9R0Q3 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmed2Q9R0Q3 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmed2Q9R0Q3 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmed2Q9R0Q3 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmed2Q9R0Q3 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmed2Q9R0Q3 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmed2Q9R0Q3 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmed2Q9R0Q3 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmed2Q9R0Q3 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmed2Q9R0Q3 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmed2Q9R0Q3 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmed2Q9R0Q3 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmed2Q9R0Q3 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmed2Q9R0Q3 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmed2Q9R0Q3 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmed2Q9R0Q3 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmed2Q9R0Q3 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmed2Q9R0Q3 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmed2Q9R0Q3 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmed2Q9R0Q3 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmed2Q9R0Q3 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmed2Q9R0Q3 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmed2Q9R0Q3 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmed2Q9R0Q3 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmed2Q9R0Q3 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmed2Q9R0Q3 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmed2Q9R0Q3 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmed2Q9R0Q3 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmed2Q9R0Q3 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmed2Q9R0Q3 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmed2Q9R0Q3 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmed2Q9R0Q3 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmed2Q9R0Q3 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmed2Q9R0Q3 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmed2Q9R0Q3 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmed2Q9R0Q3 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmed2Q9R0Q3 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmed2Q9R0Q3 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmed2Q9R0Q3 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmed2Q9R0Q3 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmed2Q9R0Q3 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmed2Q9R0Q3 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmed2Q9R0Q3 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmed2Q9R0Q3 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmed2Q9R0Q3 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmed2Q9R0Q3 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmed2Q9R0Q3 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmed2Q9R0Q3 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmed2Q9R0Q3 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmed2Q9R0Q3 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmed2Q9R0Q3 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmed2Q9R0Q3 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmed2Q9R0Q3 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmed2Q9R0Q3 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmed2Q9R0Q3 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmed2Q9R0Q3 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmed2Q9R0Q3 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmed2Q9R0Q3 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmed2Q9R0Q3 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmed2Q9R0Q3 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmed2Q9R0Q3 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmed2Q9R0Q3 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmed2Q9R0Q3 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmed2Q9R0Q3 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmed2Q9R0Q3 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmed2Q9R0Q3 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmed2Q9R0Q3 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmed2Q9R0Q3 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmed2Q9R0Q3 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmed2Q9R0Q3 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmed2Q9R0Q3 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmed2Q9R0Q3 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmed2Q9R0Q3 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmed2Q9R0Q3 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmed2Q9R0Q3 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmed2Q9R0Q3 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmed2Q9R0Q3 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmed2Q9R0Q3 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmed2Q9R0Q3 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmed2Q9R0Q3 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmed2Q9R0Q3 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmed2Q9R0Q3 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmed2Q9R0Q3 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmed2Q9R0Q3 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmed2Q9R0Q3 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmed2Q9R0Q3 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmed2Q9R0Q3 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmed2Q9R0Q3 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmed2Q9R0Q3 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmed2Q9R0Q3 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmed2Q9R0Q3 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmed2Q9R0Q3 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmed2Q9R0Q3 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmed2Q9R0Q3 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmed2Q9R0Q3 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms