Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZF2

Gpc1, Glypican-1, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc1Q9QZF2 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
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Gpc1Q9QZF2 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Gpc1Q9QZF2 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Gpc1Q9QZF2 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Gpc1Q9QZF2 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Gpc1Q9QZF2 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gpc1Q9QZF2 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gpc1Q9QZF2 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gpc1Q9QZF2 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gpc1Q9QZF2 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gpc1Q9QZF2 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Gpc1Q9QZF2 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gpc1Q9QZF2 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gpc1Q9QZF2 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gpc1Q9QZF2 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Gpc1Q9QZF2 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Gpc1Q9QZF2 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Gpc1Q9QZF2 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Gpc1Q9QZF2 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gpc1Q9QZF2 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gpc1Q9QZF2 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Gpc1Q9QZF2 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gpc1Q9QZF2 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gpc1Q9QZF2 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Gpc1Q9QZF2 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gpc1Q9QZF2 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Gpc1Q9QZF2 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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