Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZE5

Copg1, Coatomer subunit gamma-1, mousemouse

Predictions only

Length 874 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copg1Q9QZE5 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Copg1Q9QZE5 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Copg1Q9QZE5 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Copg1Q9QZE5 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Copg1Q9QZE5 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Copg1Q9QZE5 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Copg1Q9QZE5 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Copg1Q9QZE5 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Copg1Q9QZE5 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Copg1Q9QZE5 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Copg1Q9QZE5 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Copg1Q9QZE5 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Copg1Q9QZE5 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Copg1Q9QZE5 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Copg1Q9QZE5 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Copg1Q9QZE5 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Copg1Q9QZE5 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Copg1Q9QZE5 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Copg1Q9QZE5 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Copg1Q9QZE5 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Copg1Q9QZE5 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Copg1Q9QZE5 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Copg1Q9QZE5 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Copg1Q9QZE5 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Copg1Q9QZE5 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Copg1Q9QZE5 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Copg1Q9QZE5 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Copg1Q9QZE5 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Copg1Q9QZE5 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Copg1Q9QZE5 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Copg1Q9QZE5 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Copg1Q9QZE5 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Copg1Q9QZE5 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Copg1Q9QZE5 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Copg1Q9QZE5 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Copg1Q9QZE5 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Copg1Q9QZE5 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Copg1Q9QZE5 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Copg1Q9QZE5 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Copg1Q9QZE5 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Copg1Q9QZE5 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Copg1Q9QZE5 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Copg1Q9QZE5 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Copg1Q9QZE5 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Copg1Q9QZE5 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Copg1Q9QZE5 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Copg1Q9QZE5 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Copg1Q9QZE5 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Copg1Q9QZE5 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Copg1Q9QZE5 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Copg1Q9QZE5 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Copg1Q9QZE5 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Copg1Q9QZE5 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Copg1Q9QZE5 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Copg1Q9QZE5 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Copg1Q9QZE5 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Copg1Q9QZE5 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Copg1Q9QZE5 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Copg1Q9QZE5 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Copg1Q9QZE5 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Copg1Q9QZE5 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Copg1Q9QZE5 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Copg1Q9QZE5 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Copg1Q9QZE5 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Copg1Q9QZE5 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Copg1Q9QZE5 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Copg1Q9QZE5 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Copg1Q9QZE5 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Copg1Q9QZE5 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Copg1Q9QZE5 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Copg1Q9QZE5 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Copg1Q9QZE5 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Copg1Q9QZE5 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Copg1Q9QZE5 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Copg1Q9QZE5 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Copg1Q9QZE5 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Copg1Q9QZE5 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Copg1Q9QZE5 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Copg1Q9QZE5 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Copg1Q9QZE5 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Copg1Q9QZE5 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Copg1Q9QZE5 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Copg1Q9QZE5 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Copg1Q9QZE5 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Copg1Q9QZE5 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Copg1Q9QZE5 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Copg1Q9QZE5 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Copg1Q9QZE5 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Copg1Q9QZE5 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Copg1Q9QZE5 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Copg1Q9QZE5 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Copg1Q9QZE5 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Copg1Q9QZE5 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Copg1Q9QZE5 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Copg1Q9QZE5 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Copg1Q9QZE5 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Copg1Q9QZE5 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Copg1Q9QZE5 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Copg1Q9QZE5 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Copg1Q9QZE5 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms