Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnnt3Q9QZ47 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnnt3Q9QZ47 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnnt3Q9QZ47 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnnt3Q9QZ47 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnnt3Q9QZ47 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tnnt3Q9QZ47 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tnnt3Q9QZ47 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tnnt3Q9QZ47 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tnnt3Q9QZ47 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tnnt3Q9QZ47 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tnnt3Q9QZ47 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tnnt3Q9QZ47 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tnnt3Q9QZ47 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tnnt3Q9QZ47 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tnnt3Q9QZ47 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tnnt3Q9QZ47 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tnnt3Q9QZ47 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tnnt3Q9QZ47 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tnnt3Q9QZ47 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tnnt3Q9QZ47 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tnnt3Q9QZ47 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tnnt3Q9QZ47 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tnnt3Q9QZ47 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tnnt3Q9QZ47 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tnnt3Q9QZ47 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tnnt3Q9QZ47 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tnnt3Q9QZ47 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tnnt3Q9QZ47 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tnnt3Q9QZ47 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tnnt3Q9QZ47 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tnnt3Q9QZ47 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tnnt3Q9QZ47 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tnnt3Q9QZ47 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tnnt3Q9QZ47 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tnnt3Q9QZ47 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tnnt3Q9QZ47 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tnnt3Q9QZ47 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tnnt3Q9QZ47 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tnnt3Q9QZ47 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tnnt3Q9QZ47 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tnnt3Q9QZ47 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tnnt3Q9QZ47 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tnnt3Q9QZ47 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Tnnt3Q9QZ47 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Tnnt3Q9QZ47 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tnnt3Q9QZ47 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tnnt3Q9QZ47 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tnnt3Q9QZ47 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tnnt3Q9QZ47 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tnnt3Q9QZ47 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tnnt3Q9QZ47 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tnnt3Q9QZ47 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tnnt3Q9QZ47 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tnnt3Q9QZ47 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tnnt3Q9QZ47 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tnnt3Q9QZ47 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tnnt3Q9QZ47 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tnnt3Q9QZ47 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tnnt3Q9QZ47 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tnnt3Q9QZ47 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tnnt3Q9QZ47 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tnnt3Q9QZ47 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tnnt3Q9QZ47 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tnnt3Q9QZ47 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tnnt3Q9QZ47 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tnnt3Q9QZ47 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tnnt3Q9QZ47 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tnnt3Q9QZ47 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tnnt3Q9QZ47 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tnnt3Q9QZ47 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tnnt3Q9QZ47 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tnnt3Q9QZ47 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tnnt3Q9QZ47 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tnnt3Q9QZ47 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tnnt3Q9QZ47 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tnnt3Q9QZ47 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tnnt3Q9QZ47 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tnnt3Q9QZ47 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tnnt3Q9QZ47 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tnnt3Q9QZ47 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tnnt3Q9QZ47 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tnnt3Q9QZ47 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tnnt3Q9QZ47 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Tnnt3Q9QZ47 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tnnt3Q9QZ47 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tnnt3Q9QZ47 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tnnt3Q9QZ47 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Tnnt3Q9QZ47 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tnnt3Q9QZ47 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tnnt3Q9QZ47 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tnnt3Q9QZ47 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tnnt3Q9QZ47 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tnnt3Q9QZ47 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tnnt3Q9QZ47 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tnnt3Q9QZ47 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tnnt3Q9QZ47 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tnnt3Q9QZ47 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tnnt3Q9QZ47 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tnnt3Q9QZ47 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms