Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY76

Vapb, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapbQ9QY76 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VapbQ9QY76 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VapbQ9QY76 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VapbQ9QY76 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VapbQ9QY76 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VapbQ9QY76 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VapbQ9QY76 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VapbQ9QY76 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VapbQ9QY76 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VapbQ9QY76 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VapbQ9QY76 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VapbQ9QY76 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VapbQ9QY76 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VapbQ9QY76 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VapbQ9QY76 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VapbQ9QY76 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VapbQ9QY76 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VapbQ9QY76 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
VapbQ9QY76 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VapbQ9QY76 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VapbQ9QY76 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
VapbQ9QY76 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VapbQ9QY76 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VapbQ9QY76 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
VapbQ9QY76 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
VapbQ9QY76 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
VapbQ9QY76 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
VapbQ9QY76 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VapbQ9QY76 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
VapbQ9QY76 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VapbQ9QY76 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
VapbQ9QY76 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VapbQ9QY76 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VapbQ9QY76 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
VapbQ9QY76 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
VapbQ9QY76 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VapbQ9QY76 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
VapbQ9QY76 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VapbQ9QY76 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VapbQ9QY76 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VapbQ9QY76 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
VapbQ9QY76 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VapbQ9QY76 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VapbQ9QY76 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VapbQ9QY76 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VapbQ9QY76 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VapbQ9QY76 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
VapbQ9QY76 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
VapbQ9QY76 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
VapbQ9QY76 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
VapbQ9QY76 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
VapbQ9QY76 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
VapbQ9QY76 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
VapbQ9QY76 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
VapbQ9QY76 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
VapbQ9QY76 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
VapbQ9QY76 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
VapbQ9QY76 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
VapbQ9QY76 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
VapbQ9QY76 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
VapbQ9QY76 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
VapbQ9QY76 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
VapbQ9QY76 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
VapbQ9QY76 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
VapbQ9QY76 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
VapbQ9QY76 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
VapbQ9QY76 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
VapbQ9QY76 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
VapbQ9QY76 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
VapbQ9QY76 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
VapbQ9QY76 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
VapbQ9QY76 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VapbQ9QY76 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VapbQ9QY76 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VapbQ9QY76 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VapbQ9QY76 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
VapbQ9QY76 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VapbQ9QY76 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
VapbQ9QY76 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VapbQ9QY76 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VapbQ9QY76 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VapbQ9QY76 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VapbQ9QY76 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VapbQ9QY76 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
VapbQ9QY76 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
VapbQ9QY76 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VapbQ9QY76 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VapbQ9QY76 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VapbQ9QY76 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
VapbQ9QY76 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
VapbQ9QY76 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VapbQ9QY76 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VapbQ9QY76 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VapbQ9QY76 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VapbQ9QY76 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VapbQ9QY76 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VapbQ9QY76 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VapbQ9QY76 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VapbQ9QY76 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VapbQ9QY76 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms