Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY23

Pkp3, Plakophilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp3Q9QY23 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkp3Q9QY23 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkp3Q9QY23 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkp3Q9QY23 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkp3Q9QY23 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkp3Q9QY23 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkp3Q9QY23 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkp3Q9QY23 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkp3Q9QY23 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkp3Q9QY23 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkp3Q9QY23 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkp3Q9QY23 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkp3Q9QY23 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkp3Q9QY23 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkp3Q9QY23 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkp3Q9QY23 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkp3Q9QY23 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkp3Q9QY23 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkp3Q9QY23 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkp3Q9QY23 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkp3Q9QY23 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkp3Q9QY23 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkp3Q9QY23 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pkp3Q9QY23 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pkp3Q9QY23 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pkp3Q9QY23 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pkp3Q9QY23 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pkp3Q9QY23 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pkp3Q9QY23 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pkp3Q9QY23 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pkp3Q9QY23 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pkp3Q9QY23 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pkp3Q9QY23 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pkp3Q9QY23 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pkp3Q9QY23 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pkp3Q9QY23 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pkp3Q9QY23 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pkp3Q9QY23 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pkp3Q9QY23 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Pkp3Q9QY23 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Pkp3Q9QY23 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pkp3Q9QY23 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pkp3Q9QY23 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pkp3Q9QY23 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pkp3Q9QY23 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Pkp3Q9QY23 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pkp3Q9QY23 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pkp3Q9QY23 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pkp3Q9QY23 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pkp3Q9QY23 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Pkp3Q9QY23 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pkp3Q9QY23 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pkp3Q9QY23 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pkp3Q9QY23 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pkp3Q9QY23 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pkp3Q9QY23 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pkp3Q9QY23 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pkp3Q9QY23 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pkp3Q9QY23 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pkp3Q9QY23 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pkp3Q9QY23 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pkp3Q9QY23 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pkp3Q9QY23 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pkp3Q9QY23 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pkp3Q9QY23 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Pkp3Q9QY23 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pkp3Q9QY23 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Pkp3Q9QY23 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pkp3Q9QY23 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Pkp3Q9QY23 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pkp3Q9QY23 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Pkp3Q9QY23 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pkp3Q9QY23 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pkp3Q9QY23 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pkp3Q9QY23 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pkp3Q9QY23 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Pkp3Q9QY23 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pkp3Q9QY23 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pkp3Q9QY23 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pkp3Q9QY23 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pkp3Q9QY23 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pkp3Q9QY23 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pkp3Q9QY23 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pkp3Q9QY23 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pkp3Q9QY23 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pkp3Q9QY23 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pkp3Q9QY23 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pkp3Q9QY23 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pkp3Q9QY23 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pkp3Q9QY23 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pkp3Q9QY23 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pkp3Q9QY23 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pkp3Q9QY23 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pkp3Q9QY23 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Pkp3Q9QY23 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pkp3Q9QY23 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pkp3Q9QY23 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pkp3Q9QY23 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pkp3Q9QY23 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pkp3Q9QY23 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms