Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT9

Znf354b, Zinc finger protein 354B, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf354bQ9QXT9 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf354bQ9QXT9 Gm42626-201ENSMUST00000196866 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf354bQ9QXT9 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf354bQ9QXT9 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf354bQ9QXT9 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf354bQ9QXT9 AC106830.1-201ENSMUST00000228032 1003 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf354bQ9QXT9 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf354bQ9QXT9 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf354bQ9QXT9 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf354bQ9QXT9 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf354bQ9QXT9 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf354bQ9QXT9 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf354bQ9QXT9 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf354bQ9QXT9 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf354bQ9QXT9 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf354bQ9QXT9 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf354bQ9QXT9 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf354bQ9QXT9 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf354bQ9QXT9 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf354bQ9QXT9 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf354bQ9QXT9 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf354bQ9QXT9 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf354bQ9QXT9 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf354bQ9QXT9 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf354bQ9QXT9 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf354bQ9QXT9 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf354bQ9QXT9 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf354bQ9QXT9 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf354bQ9QXT9 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf354bQ9QXT9 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf354bQ9QXT9 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf354bQ9QXT9 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf354bQ9QXT9 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf354bQ9QXT9 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf354bQ9QXT9 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf354bQ9QXT9 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf354bQ9QXT9 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf354bQ9QXT9 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf354bQ9QXT9 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf354bQ9QXT9 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf354bQ9QXT9 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf354bQ9QXT9 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf354bQ9QXT9 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf354bQ9QXT9 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf354bQ9QXT9 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf354bQ9QXT9 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf354bQ9QXT9 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf354bQ9QXT9 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf354bQ9QXT9 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Znf354bQ9QXT9 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Znf354bQ9QXT9 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Znf354bQ9QXT9 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Znf354bQ9QXT9 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Znf354bQ9QXT9 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Znf354bQ9QXT9 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Znf354bQ9QXT9 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Znf354bQ9QXT9 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Znf354bQ9QXT9 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Znf354bQ9QXT9 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Znf354bQ9QXT9 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Znf354bQ9QXT9 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Znf354bQ9QXT9 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Znf354bQ9QXT9 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Znf354bQ9QXT9 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Znf354bQ9QXT9 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Znf354bQ9QXT9 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Znf354bQ9QXT9 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Znf354bQ9QXT9 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Znf354bQ9QXT9 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Znf354bQ9QXT9 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Znf354bQ9QXT9 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Znf354bQ9QXT9 Synj2bp-202ENSMUST00000114201 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Znf354bQ9QXT9 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Znf354bQ9QXT9 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Znf354bQ9QXT9 Gm32877-201ENSMUST00000197419 709 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Znf354bQ9QXT9 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Znf354bQ9QXT9 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Znf354bQ9QXT9 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Znf354bQ9QXT9 Letm2-206ENSMUST00000210234 837 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Znf354bQ9QXT9 AC159246.1-201ENSMUST00000214478 249 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Znf354bQ9QXT9 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Znf354bQ9QXT9 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Znf354bQ9QXT9 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Znf354bQ9QXT9 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Znf354bQ9QXT9 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Znf354bQ9QXT9 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Znf354bQ9QXT9 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Znf354bQ9QXT9 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Znf354bQ9QXT9 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Znf354bQ9QXT9 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Znf354bQ9QXT9 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Znf354bQ9QXT9 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Znf354bQ9QXT9 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Znf354bQ9QXT9 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Znf354bQ9QXT9 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Znf354bQ9QXT9 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Znf354bQ9QXT9 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Znf354bQ9QXT9 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Znf354bQ9QXT9 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Znf354bQ9QXT9 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms