Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK3

Copg2, Coatomer subunit gamma-2, mousemouse

Predictions only

Length 871 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copg2Q9QXK3 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Copg2Q9QXK3 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Copg2Q9QXK3 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Copg2Q9QXK3 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Copg2Q9QXK3 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Copg2Q9QXK3 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Copg2Q9QXK3 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Copg2Q9QXK3 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Copg2Q9QXK3 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Copg2Q9QXK3 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Copg2Q9QXK3 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Copg2Q9QXK3 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Copg2Q9QXK3 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Copg2Q9QXK3 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Copg2Q9QXK3 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Copg2Q9QXK3 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Copg2Q9QXK3 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Copg2Q9QXK3 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Copg2Q9QXK3 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Copg2Q9QXK3 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Copg2Q9QXK3 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Copg2Q9QXK3 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Copg2Q9QXK3 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Copg2Q9QXK3 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Copg2Q9QXK3 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Copg2Q9QXK3 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Copg2Q9QXK3 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Copg2Q9QXK3 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Copg2Q9QXK3 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Copg2Q9QXK3 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Copg2Q9QXK3 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Copg2Q9QXK3 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Copg2Q9QXK3 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Copg2Q9QXK3 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Copg2Q9QXK3 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Copg2Q9QXK3 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Copg2Q9QXK3 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Copg2Q9QXK3 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Copg2Q9QXK3 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Copg2Q9QXK3 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Copg2Q9QXK3 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Copg2Q9QXK3 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Copg2Q9QXK3 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Copg2Q9QXK3 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Copg2Q9QXK3 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Copg2Q9QXK3 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Copg2Q9QXK3 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Copg2Q9QXK3 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Copg2Q9QXK3 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Copg2Q9QXK3 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Copg2Q9QXK3 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Copg2Q9QXK3 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Copg2Q9QXK3 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Copg2Q9QXK3 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Copg2Q9QXK3 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Copg2Q9QXK3 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Copg2Q9QXK3 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Copg2Q9QXK3 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Copg2Q9QXK3 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Copg2Q9QXK3 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Copg2Q9QXK3 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Copg2Q9QXK3 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Copg2Q9QXK3 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Copg2Q9QXK3 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Copg2Q9QXK3 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Copg2Q9QXK3 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Copg2Q9QXK3 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Copg2Q9QXK3 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Copg2Q9QXK3 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Copg2Q9QXK3 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Copg2Q9QXK3 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Copg2Q9QXK3 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Copg2Q9QXK3 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Copg2Q9QXK3 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Copg2Q9QXK3 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Copg2Q9QXK3 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Copg2Q9QXK3 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Copg2Q9QXK3 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Copg2Q9QXK3 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Copg2Q9QXK3 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Copg2Q9QXK3 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Copg2Q9QXK3 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Copg2Q9QXK3 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Copg2Q9QXK3 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Copg2Q9QXK3 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Copg2Q9QXK3 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Copg2Q9QXK3 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Copg2Q9QXK3 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Copg2Q9QXK3 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Copg2Q9QXK3 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Copg2Q9QXK3 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Copg2Q9QXK3 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Copg2Q9QXK3 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Copg2Q9QXK3 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Copg2Q9QXK3 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Copg2Q9QXK3 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Copg2Q9QXK3 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Copg2Q9QXK3 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Copg2Q9QXK3 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Copg2Q9QXK3 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms