Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA5

Lsm4, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm4Q9QXA5 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lsm4Q9QXA5 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lsm4Q9QXA5 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lsm4Q9QXA5 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lsm4Q9QXA5 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lsm4Q9QXA5 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lsm4Q9QXA5 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lsm4Q9QXA5 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lsm4Q9QXA5 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lsm4Q9QXA5 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lsm4Q9QXA5 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lsm4Q9QXA5 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lsm4Q9QXA5 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lsm4Q9QXA5 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lsm4Q9QXA5 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lsm4Q9QXA5 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lsm4Q9QXA5 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lsm4Q9QXA5 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lsm4Q9QXA5 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Lsm4Q9QXA5 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lsm4Q9QXA5 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lsm4Q9QXA5 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lsm4Q9QXA5 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lsm4Q9QXA5 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lsm4Q9QXA5 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lsm4Q9QXA5 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lsm4Q9QXA5 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lsm4Q9QXA5 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lsm4Q9QXA5 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lsm4Q9QXA5 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lsm4Q9QXA5 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lsm4Q9QXA5 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lsm4Q9QXA5 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lsm4Q9QXA5 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lsm4Q9QXA5 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lsm4Q9QXA5 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lsm4Q9QXA5 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lsm4Q9QXA5 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lsm4Q9QXA5 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lsm4Q9QXA5 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lsm4Q9QXA5 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lsm4Q9QXA5 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lsm4Q9QXA5 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lsm4Q9QXA5 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lsm4Q9QXA5 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lsm4Q9QXA5 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lsm4Q9QXA5 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lsm4Q9QXA5 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Lsm4Q9QXA5 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lsm4Q9QXA5 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lsm4Q9QXA5 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lsm4Q9QXA5 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lsm4Q9QXA5 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lsm4Q9QXA5 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lsm4Q9QXA5 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lsm4Q9QXA5 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lsm4Q9QXA5 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lsm4Q9QXA5 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lsm4Q9QXA5 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lsm4Q9QXA5 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lsm4Q9QXA5 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lsm4Q9QXA5 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lsm4Q9QXA5 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lsm4Q9QXA5 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lsm4Q9QXA5 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lsm4Q9QXA5 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lsm4Q9QXA5 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lsm4Q9QXA5 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lsm4Q9QXA5 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Lsm4Q9QXA5 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lsm4Q9QXA5 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lsm4Q9QXA5 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lsm4Q9QXA5 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lsm4Q9QXA5 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lsm4Q9QXA5 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lsm4Q9QXA5 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lsm4Q9QXA5 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lsm4Q9QXA5 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lsm4Q9QXA5 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lsm4Q9QXA5 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lsm4Q9QXA5 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lsm4Q9QXA5 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lsm4Q9QXA5 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lsm4Q9QXA5 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lsm4Q9QXA5 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lsm4Q9QXA5 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lsm4Q9QXA5 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lsm4Q9QXA5 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Lsm4Q9QXA5 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lsm4Q9QXA5 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lsm4Q9QXA5 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lsm4Q9QXA5 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lsm4Q9QXA5 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lsm4Q9QXA5 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lsm4Q9QXA5 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lsm4Q9QXA5 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lsm4Q9QXA5 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lsm4Q9QXA5 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lsm4Q9QXA5 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lsm4Q9QXA5 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms