Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX29

Trpc5, Short transient receptor potential channel 5, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc5Q9QX29 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trpc5Q9QX29 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trpc5Q9QX29 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trpc5Q9QX29 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trpc5Q9QX29 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Trpc5Q9QX29 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trpc5Q9QX29 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trpc5Q9QX29 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Trpc5Q9QX29 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trpc5Q9QX29 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trpc5Q9QX29 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trpc5Q9QX29 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Trpc5Q9QX29 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trpc5Q9QX29 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Trpc5Q9QX29 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trpc5Q9QX29 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trpc5Q9QX29 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trpc5Q9QX29 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trpc5Q9QX29 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trpc5Q9QX29 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trpc5Q9QX29 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trpc5Q9QX29 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trpc5Q9QX29 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trpc5Q9QX29 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trpc5Q9QX29 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trpc5Q9QX29 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trpc5Q9QX29 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trpc5Q9QX29 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trpc5Q9QX29 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trpc5Q9QX29 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trpc5Q9QX29 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trpc5Q9QX29 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trpc5Q9QX29 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trpc5Q9QX29 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trpc5Q9QX29 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trpc5Q9QX29 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Trpc5Q9QX29 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trpc5Q9QX29 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trpc5Q9QX29 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trpc5Q9QX29 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trpc5Q9QX29 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Trpc5Q9QX29 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trpc5Q9QX29 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trpc5Q9QX29 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trpc5Q9QX29 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trpc5Q9QX29 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trpc5Q9QX29 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Trpc5Q9QX29 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trpc5Q9QX29 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trpc5Q9QX29 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trpc5Q9QX29 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trpc5Q9QX29 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trpc5Q9QX29 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trpc5Q9QX29 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trpc5Q9QX29 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Trpc5Q9QX29 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Trpc5Q9QX29 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trpc5Q9QX29 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trpc5Q9QX29 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trpc5Q9QX29 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trpc5Q9QX29 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trpc5Q9QX29 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trpc5Q9QX29 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trpc5Q9QX29 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trpc5Q9QX29 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trpc5Q9QX29 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trpc5Q9QX29 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trpc5Q9QX29 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trpc5Q9QX29 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trpc5Q9QX29 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trpc5Q9QX29 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Trpc5Q9QX29 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trpc5Q9QX29 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trpc5Q9QX29 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trpc5Q9QX29 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trpc5Q9QX29 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Trpc5Q9QX29 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trpc5Q9QX29 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trpc5Q9QX29 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trpc5Q9QX29 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trpc5Q9QX29 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trpc5Q9QX29 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trpc5Q9QX29 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trpc5Q9QX29 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trpc5Q9QX29 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trpc5Q9QX29 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trpc5Q9QX29 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trpc5Q9QX29 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trpc5Q9QX29 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Trpc5Q9QX29 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trpc5Q9QX29 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trpc5Q9QX29 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trpc5Q9QX29 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Trpc5Q9QX29 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Trpc5Q9QX29 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Trpc5Q9QX29 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Trpc5Q9QX29 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Trpc5Q9QX29 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Trpc5Q9QX29 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Trpc5Q9QX29 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms