Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLR9

Higd1a, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, mousemouse

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Length 95 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1aQ9JLR9 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Higd1aQ9JLR9 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Higd1aQ9JLR9 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Higd1aQ9JLR9 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Higd1aQ9JLR9 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Higd1aQ9JLR9 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Higd1aQ9JLR9 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Higd1aQ9JLR9 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Higd1aQ9JLR9 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Higd1aQ9JLR9 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Higd1aQ9JLR9 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Higd1aQ9JLR9 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Higd1aQ9JLR9 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Higd1aQ9JLR9 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Higd1aQ9JLR9 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Higd1aQ9JLR9 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Higd1aQ9JLR9 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Higd1aQ9JLR9 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Higd1aQ9JLR9 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Higd1aQ9JLR9 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Higd1aQ9JLR9 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Higd1aQ9JLR9 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Higd1aQ9JLR9 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Higd1aQ9JLR9 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Higd1aQ9JLR9 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Higd1aQ9JLR9 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Higd1aQ9JLR9 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Higd1aQ9JLR9 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Higd1aQ9JLR9 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Higd1aQ9JLR9 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Higd1aQ9JLR9 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Higd1aQ9JLR9 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Higd1aQ9JLR9 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Higd1aQ9JLR9 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Higd1aQ9JLR9 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Higd1aQ9JLR9 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Higd1aQ9JLR9 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Higd1aQ9JLR9 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Higd1aQ9JLR9 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Higd1aQ9JLR9 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Higd1aQ9JLR9 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Higd1aQ9JLR9 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Higd1aQ9JLR9 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Higd1aQ9JLR9 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Higd1aQ9JLR9 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Higd1aQ9JLR9 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Higd1aQ9JLR9 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Higd1aQ9JLR9 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Higd1aQ9JLR9 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Higd1aQ9JLR9 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Higd1aQ9JLR9 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Higd1aQ9JLR9 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Higd1aQ9JLR9 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Higd1aQ9JLR9 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Higd1aQ9JLR9 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Higd1aQ9JLR9 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Higd1aQ9JLR9 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Higd1aQ9JLR9 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Higd1aQ9JLR9 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Higd1aQ9JLR9 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Higd1aQ9JLR9 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Higd1aQ9JLR9 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Higd1aQ9JLR9 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Higd1aQ9JLR9 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Higd1aQ9JLR9 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Higd1aQ9JLR9 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Higd1aQ9JLR9 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Higd1aQ9JLR9 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Higd1aQ9JLR9 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Higd1aQ9JLR9 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Higd1aQ9JLR9 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Higd1aQ9JLR9 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Higd1aQ9JLR9 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Higd1aQ9JLR9 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Higd1aQ9JLR9 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Higd1aQ9JLR9 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Higd1aQ9JLR9 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Higd1aQ9JLR9 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Higd1aQ9JLR9 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Higd1aQ9JLR9 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Higd1aQ9JLR9 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Higd1aQ9JLR9 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Higd1aQ9JLR9 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Higd1aQ9JLR9 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Higd1aQ9JLR9 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Higd1aQ9JLR9 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Higd1aQ9JLR9 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Higd1aQ9JLR9 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Higd1aQ9JLR9 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Higd1aQ9JLR9 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Higd1aQ9JLR9 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Higd1aQ9JLR9 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Higd1aQ9JLR9 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Higd1aQ9JLR9 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Higd1aQ9JLR9 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Higd1aQ9JLR9 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Higd1aQ9JLR9 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Higd1aQ9JLR9 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Higd1aQ9JLR9 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Higd1aQ9JLR9 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
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