Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
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Col5a3Q9JLI2 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col5a3Q9JLI2 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col5a3Q9JLI2 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col5a3Q9JLI2 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col5a3Q9JLI2 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Col5a3Q9JLI2 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col5a3Q9JLI2 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col5a3Q9JLI2 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Col5a3Q9JLI2 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col5a3Q9JLI2 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col5a3Q9JLI2 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col5a3Q9JLI2 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Col5a3Q9JLI2 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col5a3Q9JLI2 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col5a3Q9JLI2 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col5a3Q9JLI2 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col5a3Q9JLI2 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
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Col5a3Q9JLI2 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Col5a3Q9JLI2 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Col5a3Q9JLI2 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Col5a3Q9JLI2 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col5a3Q9JLI2 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col5a3Q9JLI2 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col5a3Q9JLI2 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col5a3Q9JLI2 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col5a3Q9JLI2 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Col5a3Q9JLI2 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Col5a3Q9JLI2 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col5a3Q9JLI2 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col5a3Q9JLI2 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Col5a3Q9JLI2 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Col5a3Q9JLI2 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col5a3Q9JLI2 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col5a3Q9JLI2 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col5a3Q9JLI2 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col5a3Q9JLI2 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col5a3Q9JLI2 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col5a3Q9JLI2 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Col5a3Q9JLI2 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Col5a3Q9JLI2 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Col5a3Q9JLI2 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col5a3Q9JLI2 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Col5a3Q9JLI2 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col5a3Q9JLI2 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Col5a3Q9JLI2 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Col5a3Q9JLI2 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col5a3Q9JLI2 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Col5a3Q9JLI2 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col5a3Q9JLI2 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col5a3Q9JLI2 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col5a3Q9JLI2 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col5a3Q9JLI2 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col5a3Q9JLI2 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col5a3Q9JLI2 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col5a3Q9JLI2 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col5a3Q9JLI2 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col5a3Q9JLI2 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col5a3Q9JLI2 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Col5a3Q9JLI2 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Col5a3Q9JLI2 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col5a3Q9JLI2 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col5a3Q9JLI2 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col5a3Q9JLI2 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col5a3Q9JLI2 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col5a3Q9JLI2 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms