Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL18

Bace2, Beta-secretase 2, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace2Q9JL18 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bace2Q9JL18 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Bace2Q9JL18 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bace2Q9JL18 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bace2Q9JL18 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bace2Q9JL18 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bace2Q9JL18 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bace2Q9JL18 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bace2Q9JL18 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bace2Q9JL18 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bace2Q9JL18 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bace2Q9JL18 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bace2Q9JL18 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bace2Q9JL18 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Bace2Q9JL18 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bace2Q9JL18 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bace2Q9JL18 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bace2Q9JL18 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bace2Q9JL18 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bace2Q9JL18 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Bace2Q9JL18 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bace2Q9JL18 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bace2Q9JL18 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Bace2Q9JL18 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bace2Q9JL18 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Bace2Q9JL18 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bace2Q9JL18 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bace2Q9JL18 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bace2Q9JL18 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bace2Q9JL18 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bace2Q9JL18 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bace2Q9JL18 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bace2Q9JL18 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bace2Q9JL18 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bace2Q9JL18 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bace2Q9JL18 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bace2Q9JL18 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bace2Q9JL18 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bace2Q9JL18 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bace2Q9JL18 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bace2Q9JL18 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bace2Q9JL18 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bace2Q9JL18 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bace2Q9JL18 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bace2Q9JL18 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bace2Q9JL18 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bace2Q9JL18 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bace2Q9JL18 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bace2Q9JL18 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Bace2Q9JL18 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bace2Q9JL18 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bace2Q9JL18 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bace2Q9JL18 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bace2Q9JL18 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bace2Q9JL18 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bace2Q9JL18 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bace2Q9JL18 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bace2Q9JL18 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bace2Q9JL18 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bace2Q9JL18 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bace2Q9JL18 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bace2Q9JL18 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bace2Q9JL18 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bace2Q9JL18 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bace2Q9JL18 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bace2Q9JL18 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bace2Q9JL18 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bace2Q9JL18 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bace2Q9JL18 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bace2Q9JL18 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bace2Q9JL18 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bace2Q9JL18 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bace2Q9JL18 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bace2Q9JL18 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bace2Q9JL18 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bace2Q9JL18 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bace2Q9JL18 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bace2Q9JL18 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bace2Q9JL18 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bace2Q9JL18 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bace2Q9JL18 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bace2Q9JL18 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bace2Q9JL18 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bace2Q9JL18 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bace2Q9JL18 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bace2Q9JL18 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bace2Q9JL18 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bace2Q9JL18 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bace2Q9JL18 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Bace2Q9JL18 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bace2Q9JL18 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bace2Q9JL18 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bace2Q9JL18 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bace2Q9JL18 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bace2Q9JL18 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bace2Q9JL18 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bace2Q9JL18 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bace2Q9JL18 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bace2Q9JL18 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bace2Q9JL18 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms