Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKY0

Cnot9, CCR4-NOT transcription complex subunit 9, mousemouse

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Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot9Q9JKY0 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
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Cnot9Q9JKY0 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cnot9Q9JKY0 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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