Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX4

Aatf, Protein AATF, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 526 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AatfQ9JKX4 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AatfQ9JKX4 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
AatfQ9JKX4 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
AatfQ9JKX4 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AatfQ9JKX4 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AatfQ9JKX4 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AatfQ9JKX4 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AatfQ9JKX4 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AatfQ9JKX4 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AatfQ9JKX4 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
AatfQ9JKX4 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AatfQ9JKX4 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AatfQ9JKX4 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AatfQ9JKX4 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AatfQ9JKX4 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AatfQ9JKX4 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AatfQ9JKX4 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AatfQ9JKX4 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AatfQ9JKX4 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AatfQ9JKX4 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AatfQ9JKX4 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AatfQ9JKX4 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
AatfQ9JKX4 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AatfQ9JKX4 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AatfQ9JKX4 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AatfQ9JKX4 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AatfQ9JKX4 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AatfQ9JKX4 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AatfQ9JKX4 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
AatfQ9JKX4 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AatfQ9JKX4 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AatfQ9JKX4 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AatfQ9JKX4 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AatfQ9JKX4 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AatfQ9JKX4 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AatfQ9JKX4 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
AatfQ9JKX4 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AatfQ9JKX4 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AatfQ9JKX4 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AatfQ9JKX4 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
AatfQ9JKX4 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AatfQ9JKX4 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AatfQ9JKX4 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AatfQ9JKX4 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AatfQ9JKX4 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AatfQ9JKX4 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AatfQ9JKX4 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AatfQ9JKX4 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AatfQ9JKX4 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AatfQ9JKX4 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AatfQ9JKX4 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AatfQ9JKX4 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AatfQ9JKX4 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AatfQ9JKX4 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AatfQ9JKX4 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AatfQ9JKX4 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AatfQ9JKX4 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AatfQ9JKX4 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AatfQ9JKX4 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AatfQ9JKX4 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AatfQ9JKX4 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AatfQ9JKX4 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AatfQ9JKX4 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AatfQ9JKX4 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
AatfQ9JKX4 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AatfQ9JKX4 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AatfQ9JKX4 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AatfQ9JKX4 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AatfQ9JKX4 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
AatfQ9JKX4 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AatfQ9JKX4 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AatfQ9JKX4 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AatfQ9JKX4 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AatfQ9JKX4 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AatfQ9JKX4 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AatfQ9JKX4 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AatfQ9JKX4 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
AatfQ9JKX4 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AatfQ9JKX4 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AatfQ9JKX4 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
AatfQ9JKX4 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AatfQ9JKX4 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
AatfQ9JKX4 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
AatfQ9JKX4 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AatfQ9JKX4 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AatfQ9JKX4 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AatfQ9JKX4 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AatfQ9JKX4 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AatfQ9JKX4 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AatfQ9JKX4 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AatfQ9JKX4 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AatfQ9JKX4 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AatfQ9JKX4 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AatfQ9JKX4 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AatfQ9JKX4 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
AatfQ9JKX4 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AatfQ9JKX4 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AatfQ9JKX4 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AatfQ9JKX4 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AatfQ9JKX4 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms