Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS5

Habp4, Intracellular hyaluronan-binding protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Habp4Q9JKS5 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Habp4Q9JKS5 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Habp4Q9JKS5 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Habp4Q9JKS5 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Habp4Q9JKS5 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Habp4Q9JKS5 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Habp4Q9JKS5 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Habp4Q9JKS5 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Habp4Q9JKS5 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Habp4Q9JKS5 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Habp4Q9JKS5 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Habp4Q9JKS5 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Habp4Q9JKS5 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Habp4Q9JKS5 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Habp4Q9JKS5 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Habp4Q9JKS5 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Habp4Q9JKS5 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Habp4Q9JKS5 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Habp4Q9JKS5 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Habp4Q9JKS5 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Habp4Q9JKS5 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Habp4Q9JKS5 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Habp4Q9JKS5 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Habp4Q9JKS5 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Habp4Q9JKS5 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Habp4Q9JKS5 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Habp4Q9JKS5 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Habp4Q9JKS5 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Habp4Q9JKS5 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Habp4Q9JKS5 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Habp4Q9JKS5 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Habp4Q9JKS5 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Habp4Q9JKS5 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Habp4Q9JKS5 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Habp4Q9JKS5 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Habp4Q9JKS5 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Habp4Q9JKS5 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Habp4Q9JKS5 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Habp4Q9JKS5 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Habp4Q9JKS5 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Habp4Q9JKS5 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Habp4Q9JKS5 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Habp4Q9JKS5 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Habp4Q9JKS5 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Habp4Q9JKS5 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Habp4Q9JKS5 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Habp4Q9JKS5 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Habp4Q9JKS5 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Habp4Q9JKS5 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Habp4Q9JKS5 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Habp4Q9JKS5 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Habp4Q9JKS5 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Habp4Q9JKS5 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Habp4Q9JKS5 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Habp4Q9JKS5 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Habp4Q9JKS5 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Habp4Q9JKS5 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Habp4Q9JKS5 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Habp4Q9JKS5 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Habp4Q9JKS5 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Habp4Q9JKS5 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Habp4Q9JKS5 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Habp4Q9JKS5 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Habp4Q9JKS5 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Habp4Q9JKS5 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Habp4Q9JKS5 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Habp4Q9JKS5 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Habp4Q9JKS5 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Habp4Q9JKS5 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Habp4Q9JKS5 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Habp4Q9JKS5 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Habp4Q9JKS5 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Habp4Q9JKS5 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Habp4Q9JKS5 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Habp4Q9JKS5 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Habp4Q9JKS5 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Habp4Q9JKS5 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Habp4Q9JKS5 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Habp4Q9JKS5 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Habp4Q9JKS5 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Habp4Q9JKS5 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Habp4Q9JKS5 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Habp4Q9JKS5 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Habp4Q9JKS5 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Habp4Q9JKS5 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Habp4Q9JKS5 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Habp4Q9JKS5 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Habp4Q9JKS5 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Habp4Q9JKS5 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Habp4Q9JKS5 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Habp4Q9JKS5 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Habp4Q9JKS5 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Habp4Q9JKS5 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Habp4Q9JKS5 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Habp4Q9JKS5 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Habp4Q9JKS5 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Habp4Q9JKS5 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Habp4Q9JKS5 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Habp4Q9JKS5 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Habp4Q9JKS5 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms