Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE2

Trem1, Triggering receptor expressed on myeloid cells 1, mousemouse

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem1Q9JKE2 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trem1Q9JKE2 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trem1Q9JKE2 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trem1Q9JKE2 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trem1Q9JKE2 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trem1Q9JKE2 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trem1Q9JKE2 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trem1Q9JKE2 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trem1Q9JKE2 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trem1Q9JKE2 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trem1Q9JKE2 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trem1Q9JKE2 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trem1Q9JKE2 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trem1Q9JKE2 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trem1Q9JKE2 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trem1Q9JKE2 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trem1Q9JKE2 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Trem1Q9JKE2 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trem1Q9JKE2 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trem1Q9JKE2 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trem1Q9JKE2 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trem1Q9JKE2 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trem1Q9JKE2 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trem1Q9JKE2 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trem1Q9JKE2 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trem1Q9JKE2 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Trem1Q9JKE2 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trem1Q9JKE2 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trem1Q9JKE2 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trem1Q9JKE2 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trem1Q9JKE2 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trem1Q9JKE2 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trem1Q9JKE2 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trem1Q9JKE2 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trem1Q9JKE2 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trem1Q9JKE2 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Trem1Q9JKE2 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trem1Q9JKE2 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trem1Q9JKE2 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trem1Q9JKE2 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trem1Q9JKE2 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trem1Q9JKE2 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trem1Q9JKE2 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trem1Q9JKE2 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trem1Q9JKE2 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trem1Q9JKE2 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trem1Q9JKE2 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Trem1Q9JKE2 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Trem1Q9JKE2 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trem1Q9JKE2 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trem1Q9JKE2 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trem1Q9JKE2 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trem1Q9JKE2 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trem1Q9JKE2 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trem1Q9JKE2 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trem1Q9JKE2 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trem1Q9JKE2 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trem1Q9JKE2 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trem1Q9JKE2 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trem1Q9JKE2 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trem1Q9JKE2 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trem1Q9JKE2 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trem1Q9JKE2 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trem1Q9JKE2 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Trem1Q9JKE2 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trem1Q9JKE2 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trem1Q9JKE2 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trem1Q9JKE2 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trem1Q9JKE2 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trem1Q9JKE2 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trem1Q9JKE2 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trem1Q9JKE2 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trem1Q9JKE2 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trem1Q9JKE2 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trem1Q9JKE2 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trem1Q9JKE2 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trem1Q9JKE2 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trem1Q9JKE2 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Trem1Q9JKE2 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trem1Q9JKE2 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trem1Q9JKE2 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trem1Q9JKE2 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trem1Q9JKE2 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Trem1Q9JKE2 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trem1Q9JKE2 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trem1Q9JKE2 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trem1Q9JKE2 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trem1Q9JKE2 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Trem1Q9JKE2 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trem1Q9JKE2 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trem1Q9JKE2 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trem1Q9JKE2 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trem1Q9JKE2 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trem1Q9JKE2 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Trem1Q9JKE2 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trem1Q9JKE2 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trem1Q9JKE2 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trem1Q9JKE2 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trem1Q9JKE2 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trem1Q9JKE2 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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