Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK54

Msgn1, Mesogenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msgn1Q9JK54 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Msgn1Q9JK54 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Msgn1Q9JK54 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Msgn1Q9JK54 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Msgn1Q9JK54 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Msgn1Q9JK54 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Msgn1Q9JK54 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Msgn1Q9JK54 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Msgn1Q9JK54 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Msgn1Q9JK54 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Msgn1Q9JK54 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Msgn1Q9JK54 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Msgn1Q9JK54 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Msgn1Q9JK54 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Msgn1Q9JK54 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Msgn1Q9JK54 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Msgn1Q9JK54 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Msgn1Q9JK54 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Msgn1Q9JK54 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Msgn1Q9JK54 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Msgn1Q9JK54 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Msgn1Q9JK54 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Msgn1Q9JK54 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Msgn1Q9JK54 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Msgn1Q9JK54 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Msgn1Q9JK54 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Msgn1Q9JK54 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Msgn1Q9JK54 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Msgn1Q9JK54 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Msgn1Q9JK54 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Msgn1Q9JK54 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Msgn1Q9JK54 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Msgn1Q9JK54 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Msgn1Q9JK54 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Msgn1Q9JK54 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Msgn1Q9JK54 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Msgn1Q9JK54 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Msgn1Q9JK54 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Msgn1Q9JK54 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Msgn1Q9JK54 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Msgn1Q9JK54 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Msgn1Q9JK54 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Msgn1Q9JK54 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Msgn1Q9JK54 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Msgn1Q9JK54 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Msgn1Q9JK54 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Msgn1Q9JK54 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Msgn1Q9JK54 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Msgn1Q9JK54 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Msgn1Q9JK54 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Msgn1Q9JK54 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Msgn1Q9JK54 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Msgn1Q9JK54 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Msgn1Q9JK54 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Msgn1Q9JK54 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Msgn1Q9JK54 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Msgn1Q9JK54 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Msgn1Q9JK54 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Msgn1Q9JK54 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Msgn1Q9JK54 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Msgn1Q9JK54 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Msgn1Q9JK54 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Msgn1Q9JK54 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Msgn1Q9JK54 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Msgn1Q9JK54 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Msgn1Q9JK54 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Msgn1Q9JK54 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Msgn1Q9JK54 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Msgn1Q9JK54 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Msgn1Q9JK54 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Msgn1Q9JK54 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Msgn1Q9JK54 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Msgn1Q9JK54 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Msgn1Q9JK54 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Msgn1Q9JK54 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Msgn1Q9JK54 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Msgn1Q9JK54 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Msgn1Q9JK54 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Msgn1Q9JK54 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Msgn1Q9JK54 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Msgn1Q9JK54 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Msgn1Q9JK54 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Msgn1Q9JK54 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Msgn1Q9JK54 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Msgn1Q9JK54 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Msgn1Q9JK54 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Msgn1Q9JK54 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Msgn1Q9JK54 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Msgn1Q9JK54 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Msgn1Q9JK54 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Msgn1Q9JK54 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Msgn1Q9JK54 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Msgn1Q9JK54 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Msgn1Q9JK54 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Msgn1Q9JK54 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Msgn1Q9JK54 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Msgn1Q9JK54 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Msgn1Q9JK54 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Msgn1Q9JK54 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Msgn1Q9JK54 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.7 ms