Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ89

Ccdc86, Coiled-coil domain-containing protein 86, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc86Q9JJ89 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc86Q9JJ89 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc86Q9JJ89 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc86Q9JJ89 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc86Q9JJ89 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc86Q9JJ89 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc86Q9JJ89 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc86Q9JJ89 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc86Q9JJ89 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc86Q9JJ89 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc86Q9JJ89 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc86Q9JJ89 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc86Q9JJ89 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc86Q9JJ89 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc86Q9JJ89 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc86Q9JJ89 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc86Q9JJ89 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc86Q9JJ89 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc86Q9JJ89 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc86Q9JJ89 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc86Q9JJ89 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc86Q9JJ89 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc86Q9JJ89 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc86Q9JJ89 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc86Q9JJ89 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc86Q9JJ89 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc86Q9JJ89 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc86Q9JJ89 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc86Q9JJ89 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc86Q9JJ89 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc86Q9JJ89 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc86Q9JJ89 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc86Q9JJ89 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc86Q9JJ89 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc86Q9JJ89 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc86Q9JJ89 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc86Q9JJ89 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc86Q9JJ89 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc86Q9JJ89 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc86Q9JJ89 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc86Q9JJ89 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc86Q9JJ89 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc86Q9JJ89 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc86Q9JJ89 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc86Q9JJ89 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc86Q9JJ89 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc86Q9JJ89 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc86Q9JJ89 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc86Q9JJ89 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc86Q9JJ89 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc86Q9JJ89 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc86Q9JJ89 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc86Q9JJ89 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc86Q9JJ89 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc86Q9JJ89 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc86Q9JJ89 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc86Q9JJ89 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc86Q9JJ89 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc86Q9JJ89 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc86Q9JJ89 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc86Q9JJ89 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc86Q9JJ89 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc86Q9JJ89 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc86Q9JJ89 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc86Q9JJ89 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc86Q9JJ89 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc86Q9JJ89 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc86Q9JJ89 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc86Q9JJ89 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc86Q9JJ89 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc86Q9JJ89 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc86Q9JJ89 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc86Q9JJ89 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc86Q9JJ89 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc86Q9JJ89 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc86Q9JJ89 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc86Q9JJ89 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc86Q9JJ89 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc86Q9JJ89 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc86Q9JJ89 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc86Q9JJ89 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc86Q9JJ89 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc86Q9JJ89 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc86Q9JJ89 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc86Q9JJ89 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc86Q9JJ89 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc86Q9JJ89 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc86Q9JJ89 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc86Q9JJ89 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc86Q9JJ89 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc86Q9JJ89 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc86Q9JJ89 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc86Q9JJ89 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc86Q9JJ89 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc86Q9JJ89 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc86Q9JJ89 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc86Q9JJ89 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc86Q9JJ89 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc86Q9JJ89 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc86Q9JJ89 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms