Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI60

Lrat, Lecithin retinol acyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LratQ9JI60 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LratQ9JI60 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LratQ9JI60 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LratQ9JI60 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LratQ9JI60 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LratQ9JI60 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LratQ9JI60 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LratQ9JI60 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LratQ9JI60 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LratQ9JI60 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LratQ9JI60 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
LratQ9JI60 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
LratQ9JI60 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LratQ9JI60 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LratQ9JI60 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LratQ9JI60 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LratQ9JI60 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LratQ9JI60 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LratQ9JI60 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LratQ9JI60 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LratQ9JI60 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LratQ9JI60 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LratQ9JI60 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LratQ9JI60 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LratQ9JI60 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
LratQ9JI60 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LratQ9JI60 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LratQ9JI60 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LratQ9JI60 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LratQ9JI60 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LratQ9JI60 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LratQ9JI60 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LratQ9JI60 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LratQ9JI60 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LratQ9JI60 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LratQ9JI60 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LratQ9JI60 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LratQ9JI60 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LratQ9JI60 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LratQ9JI60 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LratQ9JI60 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LratQ9JI60 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LratQ9JI60 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LratQ9JI60 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LratQ9JI60 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LratQ9JI60 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LratQ9JI60 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LratQ9JI60 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LratQ9JI60 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LratQ9JI60 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LratQ9JI60 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LratQ9JI60 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LratQ9JI60 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LratQ9JI60 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LratQ9JI60 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LratQ9JI60 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LratQ9JI60 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LratQ9JI60 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LratQ9JI60 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LratQ9JI60 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LratQ9JI60 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LratQ9JI60 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LratQ9JI60 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LratQ9JI60 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LratQ9JI60 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LratQ9JI60 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LratQ9JI60 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LratQ9JI60 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LratQ9JI60 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LratQ9JI60 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LratQ9JI60 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LratQ9JI60 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LratQ9JI60 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LratQ9JI60 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LratQ9JI60 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LratQ9JI60 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LratQ9JI60 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LratQ9JI60 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LratQ9JI60 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LratQ9JI60 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LratQ9JI60 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
LratQ9JI60 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LratQ9JI60 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LratQ9JI60 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LratQ9JI60 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LratQ9JI60 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LratQ9JI60 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LratQ9JI60 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LratQ9JI60 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LratQ9JI60 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LratQ9JI60 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LratQ9JI60 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LratQ9JI60 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LratQ9JI60 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LratQ9JI60 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LratQ9JI60 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LratQ9JI60 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LratQ9JI60 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LratQ9JI60 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
LratQ9JI60 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms